More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2009 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 1193 aa  2330    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  42.35 
 
 		 1085 aa  734    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  33.62 
 
 		 743 aa  294  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  34.02 
 
 		 787 aa  293  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.24 
 
 		 744 aa  273  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  37.98 
 
 		 656 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  41.54 
 
 		 749 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  43.61 
 
 		 653 aa  243  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  33.97 
 
 		 639 aa  242  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  45.98 
 
 		 665 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  42.37 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  47.64 
 
 		 634 aa  234  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  45.98 
 
 		 656 aa  228  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  42.58 
 
 		 697 aa  221  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  47.39 
 
 		 619 aa  221  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  39.14 
 
 		 689 aa  217  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  39 
 
 		 725 aa  213  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  41.64 
 
 		 788 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  35.06 
 
 		 671 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  39.58 
 
 		 662 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  39.06 
 
 		 466 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  40.66 
 
 		 652 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  43.15 
 
 		 698 aa  195  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  42.91 
 
 		 725 aa  194  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 		 646 aa  194  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  39.76 
 
 		 448 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  43.24 
 
 		 697 aa  189  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  41.44 
 
 		 680 aa  188  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  44.58 
 
 		 450 aa  183  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  45.06 
 
 		 687 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  36.12 
 
 		 450 aa  182  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  42.97 
 
 		 444 aa  181  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  34.14 
 
 		 478 aa  181  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  31.29 
 
 		 682 aa  181  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  35.8 
 
 		 432 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  35.36 
 
 		 450 aa  177  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  39.13 
 
 		 441 aa  177  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  32.44 
 
 		 442 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  39.22 
 
 		 448 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  40.48 
 
 		 678 aa  174  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  31.73 
 
 		 434 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 450 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  41.37 
 
 		 445 aa  161  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  34.85 
 
 		 478 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  31.85 
 
 		 299 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  38.33 
 
 		 622 aa  149  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  33.82 
 
 		 459 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.39 
 
 		 352 aa  140  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  33.97 
 
 		 617 aa  129  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.53 
 
 		 387 aa  126  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  39.63 
 
 		 443 aa  119  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  31.33 
 
 		 570 aa  118  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  31.33 
 
 		 570 aa  118  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  43.55 
 
 		 134 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.09 
 
 		 570 aa  118  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  33.33 
 
 		 569 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30.96 
 
 		 578 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 		 577 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  30.26 
 
 		 305 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  32.16 
 
 		 580 aa  112  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.19 
 
 		 570 aa  110  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.88 
 
 		 760 aa  106  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.88 
 
 		 769 aa  103  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.02 
 
 		 754 aa  102  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.03 
 
 		 754 aa  103  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.37 
 
 		 718 aa  103  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.42 
 
 		 759 aa  101  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.06 
 
 		 768 aa  101  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.9 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.39 
 
 		 754 aa  101  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.72 
 
 		 723 aa  100  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.72 
 
 		 800 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.72 
 
 		 784 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.72 
 
 		 781 aa  99.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.62 
 
 		 781 aa  99  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.47 
 
 		 754 aa  98.6  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  27.51 
 
 		 771 aa  98.6  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  27.65 
 
 		 639 aa  98.2  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  28.26 
 
 		 766 aa  97.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  32.12 
 
 		 228 aa  97.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  26.24 
 
 		 956 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  30.48 
 
 		 722 aa  97.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  29.75 
 
 		 405 aa  96.3  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.05 
 
 		 730 aa  96.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.88 
 
 		 732 aa  96.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  37.65 
 
 		 795 aa  95.9  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.5 
 
 		 739 aa  95.9  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  27.4 
 
 		 773 aa  95.9  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  27.4 
 
 		 773 aa  95.5  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.19 
 
 		 727 aa  95.1  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.26 
 
 		 736 aa  95.1  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.38 
 
 		 742 aa  94.7  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  39.25 
 
 		 477 aa  94.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  35.98 
 
 		 468 aa  94  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  33.62 
 
 		 776 aa  94  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.82 
 
 		 737 aa  93.2  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.2 
 
 		 738 aa  93.6  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  31.6 
 
 		 367 aa  93.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.85 
 
 		 737 aa  92.8  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.88 
 
 		 739 aa  92.8  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>