More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4054 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  100 
 
 
299 aa  597  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  39.77 
 
 
352 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  48.31 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  38.75 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  39.62 
 
 
443 aa  176  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  32.59 
 
 
387 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  39.11 
 
 
743 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  37.29 
 
 
787 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  39.09 
 
 
744 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  36.84 
 
 
619 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  35.19 
 
 
1193 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  36.41 
 
 
1085 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  32.8 
 
 
478 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  33.8 
 
 
639 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  35.45 
 
 
697 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  34.4 
 
 
653 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  32.38 
 
 
657 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  34.75 
 
 
442 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  31.75 
 
 
646 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  35.45 
 
 
665 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  34.27 
 
 
662 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  33.79 
 
 
680 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  34.4 
 
 
656 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  36 
 
 
698 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  33.94 
 
 
656 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  34.55 
 
 
749 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  30.04 
 
 
725 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  33.47 
 
 
478 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  34.59 
 
 
622 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  31.54 
 
 
432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  33.19 
 
 
450 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  32.16 
 
 
448 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  34 
 
 
682 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  33.2 
 
 
448 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  32.76 
 
 
450 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  32.13 
 
 
671 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  34.4 
 
 
697 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  34.98 
 
 
788 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  30.89 
 
 
689 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  37.04 
 
 
687 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  34.62 
 
 
450 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  32.41 
 
 
652 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  30.93 
 
 
466 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  30.8 
 
 
634 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.65 
 
 
577 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  32.03 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  33.05 
 
 
578 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  32.21 
 
 
459 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 
450 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  37.65 
 
 
445 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  29.32 
 
 
429 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  28.24 
 
 
441 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.08 
 
 
570 aa  102  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  28.46 
 
 
446 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  27.8 
 
 
569 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  30.65 
 
 
431 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  29.02 
 
 
402 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  35.92 
 
 
725 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  29.07 
 
 
389 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.73 
 
 
580 aa  99.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  30.04 
 
 
407 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  26.38 
 
 
617 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  27.69 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  29.22 
 
 
369 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  34.07 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  28.27 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  28.1 
 
 
438 aa  97.1  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  31.68 
 
 
426 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  31.49 
 
 
408 aa  96.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  27.63 
 
 
443 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  32.59 
 
 
428 aa  96.3  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  28.02 
 
 
570 aa  96.3  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  27.27 
 
 
379 aa  95.9  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  27.88 
 
 
386 aa  95.9  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  28.02 
 
 
570 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  28.21 
 
 
393 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  32.24 
 
 
405 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.09 
 
 
723 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  31.32 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  28.63 
 
 
367 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  27.63 
 
 
570 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  26.01 
 
 
447 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.57 
 
 
768 aa  94.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.55 
 
 
754 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  32.6 
 
 
407 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  35.52 
 
 
404 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  35.81 
 
 
773 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  35.81 
 
 
773 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  27.42 
 
 
410 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  32.6 
 
 
407 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.95 
 
 
671 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  31.36 
 
 
866 aa  92.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  37.01 
 
 
771 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  29.26 
 
 
713 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  30.65 
 
 
829 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 
459 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  28.34 
 
 
427 aa  91.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.76 
 
 
808 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  27.82 
 
 
407 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>