More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0172 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  796    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  38.95 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.97 
 
 
352 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  43.87 
 
 
305 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.59 
 
 
299 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  44.04 
 
 
228 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  37.2 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  37.71 
 
 
743 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  34.85 
 
 
478 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  40.09 
 
 
652 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  34.91 
 
 
744 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  35.1 
 
 
1085 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  31.32 
 
 
725 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  45.65 
 
 
622 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  35.86 
 
 
450 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  36.89 
 
 
1193 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  37.07 
 
 
639 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  35.44 
 
 
450 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  37.18 
 
 
656 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  39.67 
 
 
646 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  38.14 
 
 
653 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  33.57 
 
 
657 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  40.8 
 
 
788 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  34.44 
 
 
787 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  35.66 
 
 
478 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  36.41 
 
 
619 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  38.07 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  30.08 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  32.05 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  35.81 
 
 
697 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  30.04 
 
 
434 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  33.95 
 
 
656 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30.92 
 
 
578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  38.68 
 
 
444 aa  113  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  34.84 
 
 
580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  39.05 
 
 
671 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  32.13 
 
 
569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  31.15 
 
 
570 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  31.15 
 
 
570 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.15 
 
 
570 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  39.87 
 
 
687 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  36.36 
 
 
665 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  35.03 
 
 
448 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  30.55 
 
 
577 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.98 
 
 
743 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  30.58 
 
 
450 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  33.19 
 
 
466 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  38.92 
 
 
698 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  34.03 
 
 
680 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  36.04 
 
 
689 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  31.25 
 
 
438 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  32.2 
 
 
393 aa  106  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  40.24 
 
 
445 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  36 
 
 
634 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.42 
 
 
742 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  34.2 
 
 
450 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  29.67 
 
 
284 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  29.48 
 
 
459 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.05 
 
 
754 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  41.43 
 
 
662 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.99 
 
 
570 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  31.95 
 
 
405 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.73 
 
 
742 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.05 
 
 
754 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  38.16 
 
 
682 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.2 
 
 
740 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.47 
 
 
740 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  33.2 
 
 
407 aa  99.8  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  30.6 
 
 
749 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  28.57 
 
 
443 aa  99.4  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  30.97 
 
 
410 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.91 
 
 
801 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  31.45 
 
 
431 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  38.57 
 
 
725 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  38.36 
 
 
697 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  31.4 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.74 
 
 
718 aa  96.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  30.74 
 
 
460 aa  96.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.13 
 
 
801 aa  96.3  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.1 
 
 
663 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.84 
 
 
806 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.1 
 
 
663 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.34 
 
 
614 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  33.2 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.76 
 
 
757 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  30.8 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.08 
 
 
754 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.62 
 
 
719 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  30.92 
 
 
817 aa  94  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  35.82 
 
 
317 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  30.98 
 
 
427 aa  94  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.27 
 
 
631 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  30.94 
 
 
405 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.97 
 
 
660 aa  93.6  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  29.27 
 
 
628 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  29.27 
 
 
628 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  29.27 
 
 
632 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  29.27 
 
 
628 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.27 
 
 
631 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.27 
 
 
631 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>