More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1667 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  64.7 
 
 		 580 aa  749    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  100 
 
 		 569 aa  1145    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  55.02 
 
 		 577 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  54.18 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  54.53 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  54.36 
 
 		 570 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  54.47 
 
 		 570 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  50.43 
 
 		 578 aa  571  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 		 617 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  34 
 
 		 725 aa  154  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  31.15 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  27.5 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 657 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  34.7 
 
 		 662 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  32.94 
 
 		 653 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  32.31 
 
 		 656 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  31.95 
 
 		 619 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  27.6 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  34.17 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  32.81 
 
 		 656 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  30.8 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  33.62 
 
 		 665 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  31.52 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.46 
 
 		 305 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  32.58 
 
 		 697 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  30.92 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  30.47 
 
 		 639 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  31.9 
 
 		 1085 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  30.92 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  30.35 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  30.74 
 
 		 634 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  35.52 
 
 		 466 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  30.77 
 
 		 743 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  33.61 
 
 		 459 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  32.11 
 
 		 749 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  31.4 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  29.72 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  30.24 
 
 		 478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  34.38 
 
 		 444 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  30.4 
 
 		 744 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  36.54 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  29.55 
 
 		 698 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  30.54 
 
 		 652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  29.78 
 
 		 697 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 1193 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  31.92 
 
 		 787 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  28.66 
 
 		 788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  32.13 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.23 
 
 		 352 aa  109  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  30.59 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 671 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  31.82 
 
 		 687 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  30.81 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  29.68 
 
 		 678 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  34.64 
 
 		 725 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  25.71 
 
 		 646 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  27.8 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  39.43 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  25.55 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  34.93 
 
 		 682 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  33.72 
 
 		 443 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  31.51 
 
 		 228 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  40.91 
 
 		 789 aa  98.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  97.8  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  40.56 
 
 		 775 aa  97.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  38.31 
 
 		 668 aa  97.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  37.09 
 
 		 795 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  36.6 
 
 		 711 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  29.57 
 
 		 425 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  38.81 
 
 		 772 aa  94.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  38.46 
 
 		 789 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  31.82 
 
 		 321 aa  94  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 		 698 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  31.47 
 
 		 402 aa  93.2  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  40.85 
 
 		 672 aa  92.4  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  36.02 
 
 		 676 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  30.71 
 
 		 329 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  30.71 
 
 		 329 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.91 
 
 		 732 aa  92.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 		 332 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 		 510 aa  92  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.78 
 
 		 754 aa  90.9  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.8 
 
 		 704 aa  90.9  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.3 
 
 		 736 aa  90.5  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  35.95 
 
 		 773 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.04 
 
 		 709 aa  90.5  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  29.39 
 
 		 513 aa  90.5  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  26.58 
 
 		 367 aa  90.1  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 		 773 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  29.9 
 
 		 703 aa  89.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  28.16 
 
 		 391 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  31.63 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.54 
 
 		 425 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.82 
 
 		 718 aa  90.1  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  32.8 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.02 
 
 		 737 aa  89.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.36 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  29.52 
 
 		 389 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  30.09 
 
 		 322 aa  88.2  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.41 
 
 		 801 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>