More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0165 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  100 
 
 
672 aa  1357    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  36.14 
 
 
698 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  35.34 
 
 
775 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  34.58 
 
 
655 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  33.44 
 
 
789 aa  324  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  32.35 
 
 
789 aa  317  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  31.07 
 
 
711 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  31.52 
 
 
773 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  31.51 
 
 
773 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  33.22 
 
 
772 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  31.19 
 
 
771 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  32 
 
 
771 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  35.18 
 
 
766 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  32.92 
 
 
795 aa  293  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  31.58 
 
 
686 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  33.94 
 
 
640 aa  253  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  32.67 
 
 
676 aa  250  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  34.55 
 
 
668 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  33.98 
 
 
677 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  31.65 
 
 
680 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  31.11 
 
 
680 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  32.48 
 
 
573 aa  204  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 
731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  28.63 
 
 
753 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.83 
 
 
739 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  41.77 
 
 
578 aa  104  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.02 
 
 
719 aa  104  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.41 
 
 
738 aa  103  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.03 
 
 
738 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  24.72 
 
 
713 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.07 
 
 
773 aa  97.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.24 
 
 
805 aa  96.3  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.4 
 
 
763 aa  95.9  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  38.79 
 
 
577 aa  95.1  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.72 
 
 
810 aa  93.6  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.81 
 
 
709 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.21 
 
 
704 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.75 
 
 
742 aa  93.6  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.73 
 
 
755 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.99 
 
 
754 aa  92.8  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  40.85 
 
 
569 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.54 
 
 
754 aa  92.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  41.55 
 
 
580 aa  91.3  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.09 
 
 
701 aa  91.3  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.8 
 
 
805 aa  90.9  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  23.14 
 
 
699 aa  90.9  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.08 
 
 
757 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  24.2 
 
 
746 aa  90.1  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.94 
 
 
808 aa  90.5  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.56 
 
 
801 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  24.4 
 
 
703 aa  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  26.52 
 
 
550 aa  89.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  41.48 
 
 
228 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  33.64 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.42 
 
 
757 aa  88.6  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.32 
 
 
757 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.12 
 
 
754 aa  87.8  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.56 
 
 
740 aa  88.2  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.06 
 
 
806 aa  87.8  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  38.81 
 
 
299 aa  87  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.55 
 
 
742 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.61 
 
 
370 aa  86.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.45 
 
 
740 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  38.03 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
810 aa  85.9  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  38.03 
 
 
570 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  38.03 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  24.14 
 
 
703 aa  85.5  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.63 
 
 
721 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.01 
 
 
743 aa  84.7  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.06 
 
 
727 aa  84.7  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  24.4 
 
 
739 aa  84.7  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  25.43 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.2 
 
 
732 aa  84  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.44 
 
 
768 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  25.82 
 
 
764 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
659 aa  83.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  40.83 
 
 
466 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  25.74 
 
 
718 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.42 
 
 
772 aa  82.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  33.13 
 
 
652 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.19 
 
 
801 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  34.81 
 
 
1085 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.05 
 
 
718 aa  82.8  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  26.3 
 
 
763 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.55 
 
 
753 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  30.69 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  34.81 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  29.89 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.88 
 
 
769 aa  80.9  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.97 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.42 
 
 
754 aa  80.9  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  36.15 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.01 
 
 
651 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.66 
 
 
723 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  35.61 
 
 
305 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.27 
 
 
760 aa  79.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.65 
 
 
715 aa  79  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  33.98 
 
 
634 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.41 
 
 
628 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.185769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>