More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1259 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 573 aa  1190    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  64.81 
 
 		 731 aa  769    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 		 753 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  31.87 
 
 		 655 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  33.68 
 
 		 766 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.49 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  31.94 
 
 		 771 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  33.26 
 
 		 771 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  32.54 
 
 		 711 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  32.48 
 
 		 672 aa  204  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  32.33 
 
 		 773 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 		 773 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  30.85 
 
 		 789 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  31 
 
 		 795 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  30.32 
 
 		 775 aa  191  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  30.92 
 
 		 772 aa  183  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  29.88 
 
 		 789 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  30.13 
 
 		 686 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  29.64 
 
 		 676 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  24.51 
 
 		 640 aa  159  9e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  28.03 
 
 		 668 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  30.89 
 
 		 680 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  30.43 
 
 		 680 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  29.5 
 
 		 677 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.85 
 
 		 742 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.17 
 
 		 743 aa  97.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.51 
 
 		 740 aa  97.1  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.93 
 
 		 740 aa  95.9  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.92 
 
 		 732 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.14 
 
 		 773 aa  95.1  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  27.27 
 
 		 803 aa  94.7  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  40.91 
 
 		 617 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.25 
 
 		 772 aa  94.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.16 
 
 		 739 aa  93.6  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30.08 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  37.5 
 
 		 305 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.47 
 
 		 738 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.01 
 
 		 704 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.83 
 
 		 757 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.66 
 
 		 757 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5232  AAA ATPase, central region  27.23 
 
 		 688 aa  91.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000286955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.33 
 
 		 718 aa  91.7  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.08 
 
 		 742 aa  90.9  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.36 
 
 		 738 aa  90.1  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.47 
 
 		 804 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.22 
 
 		 756 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  31.86 
 
 		 743 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  32.8 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1548  AAA ATPase, central region  26.62 
 
 		 688 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000910509  normal  0.627937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  27.3 
 
 		 725 aa  88.2  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.81 
 
 		 731 aa  87  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  25.88 
 
 		 754 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  30.41 
 
 		 744 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  30.85 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.04 
 
 		 731 aa  84.7  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  29.9 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.28 
 
 		 769 aa  84.3  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.27 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  25.78 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  29.55 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.99 
 
 		 723 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  24.94 
 
 		 647 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.86 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.77 
 
 		 759 aa  83.6  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  34.88 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.89 
 
 		 755 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  35.37 
 
 		 450 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.25 
 
 		 731 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  30.59 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.23 
 
 		 760 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  25.76 
 
 		 1085 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  32.84 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  33.55 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  27.91 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  37.69 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  23.57 
 
 		 703 aa  81.6  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.08 
 
 		 577 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  25.24 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.31 
 
 		 801 aa  81.3  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0668  AAA ATPase  33.99 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  25.91 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  31.03 
 
 		 1193 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13383  predicted protein  40.48 
 
 		 164 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.27 
 
 		 768 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  37.01 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  33.57 
 
 		 478 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.75 
 
 		 757 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  26.13 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  34.11 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.97 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  33.53 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  32.56 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  26.54 
 
 		 746 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  30.38 
 
 		 697 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  33.33 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  28.9 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  34.62 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>