More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0668 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0668  AAA ATPase  100 
 
 		 480 aa  978    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4272  ATPase central domain-containing protein  58.4 
 
 		 482 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.96 
 
 		 662 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.62 
 
 		 783 aa  119  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.01 
 
 		 801 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  33.47 
 
 		 697 aa  118  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  31.91 
 
 		 682 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.42 
 
 		 653 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.62 
 
 		 685 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  33.33 
 
 		 617 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.86 
 
 		 798 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 		 743 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.58 
 
 		 671 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.12 
 
 		 781 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  32.89 
 
 		 617 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.86 
 
 		 760 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  32.89 
 
 		 617 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.84 
 
 		 742 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  33.47 
 
 		 769 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.33 
 
 		 704 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  33.18 
 
 		 784 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 		 740 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.19 
 
 		 672 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  33.49 
 
 		 632 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.88 
 
 		 669 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.84 
 
 		 620 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.48 
 
 		 793 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.42 
 
 		 639 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  33.65 
 
 		 783 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.77 
 
 		 696 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  33.65 
 
 		 783 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.84 
 
 		 742 aa  113  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  32.89 
 
 		 619 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  34.12 
 
 		 760 aa  113  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.42 
 
 		 671 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.18 
 
 		 794 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  30.34 
 
 		 866 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.17 
 
 		 754 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.51 
 
 		 743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  30.71 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.02 
 
 		 650 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  32.02 
 
 		 617 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.74 
 
 		 615 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 		 646 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.36 
 
 		 608 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  32.02 
 
 		 616 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.43 
 
 		 630 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  31.36 
 
 		 499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.17 
 
 		 754 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  30.08 
 
 		 700 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.2 
 
 		 659 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.85 
 
 		 804 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  30.71 
 
 		 643 aa  110  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.36 
 
 		 604 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.49 
 
 		 617 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  32.74 
 
 		 613 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.3 
 
 		 651 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.71 
 
 		 757 aa  110  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 		 655 aa  110  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.72 
 
 		 616 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  34.1 
 
 		 639 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.49 
 
 		 750 aa  109  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  27.82 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.96 
 
 		 697 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 616 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.04 
 
 		 633 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.04 
 
 		 633 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.86 
 
 		 740 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 612 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.51 
 
 		 687 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.76 
 
 		 662 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.31 
 
 		 677 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 616 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.96 
 
 		 697 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  33.02 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  31.91 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.28 
 
 		 753 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.66 
 
 		 656 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.08 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  31.64 
 
 		 695 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.39 
 
 		 641 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.91 
 
 		 613 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  32.31 
 
 		 721 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.46 
 
 		 640 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.08 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.3 
 
 		 805 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  31.02 
 
 		 645 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.6 
 
 		 633 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.91 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.46 
 
 		 638 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.2 
 
 		 652 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.91 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 		 810 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  33.02 
 
 		 615 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.2 
 
 		 656 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.08 
 
 		 608 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  31.08 
 
 		 639 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  30.47 
 
 		 654 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  32.35 
 
 		 651 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.18 
 
 		 618 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>