More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4272 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4272  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  984    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0668  AAA ATPase  58.4 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  32.49 
 
 		 769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  31.58 
 
 		 623 aa  117  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  30.77 
 
 		 682 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.78 
 
 		 801 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  30.8 
 
 		 697 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 		 866 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.8 
 
 		 793 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.79 
 
 		 614 aa  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.51 
 
 		 760 aa  113  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.03 
 
 		 671 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.03 
 
 		 669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  29.46 
 
 		 700 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.57 
 
 		 696 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.22 
 
 		 620 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.03 
 
 		 672 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  29.18 
 
 		 617 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.91 
 
 		 671 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  30.8 
 
 		 784 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.29 
 
 		 639 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.6 
 
 		 662 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.7 
 
 		 677 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.94 
 
 		 704 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.89 
 
 		 616 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.47 
 
 		 643 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.89 
 
 		 616 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  31.8 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  30.8 
 
 		 783 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  30.8 
 
 		 783 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  28.76 
 
 		 798 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  30.13 
 
 		 641 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  28.95 
 
 		 663 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.02 
 
 		 697 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.06 
 
 		 753 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.02 
 
 		 697 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.45 
 
 		 599 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.82 
 
 		 667 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.36 
 
 		 794 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0489  putative cell division protease FtsH-like protein  30.09 
 
 		 643 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  28.76 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.17 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1761  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.09 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.91 
 
 		 679 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  29.49 
 
 		 753 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.31 
 
 		 685 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  28.76 
 
 		 617 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.76 
 
 		 617 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  29.61 
 
 		 681 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.36 
 
 		 781 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.48 
 
 		 659 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  29.18 
 
 		 645 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.95 
 
 		 673 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.95 
 
 		 673 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.44 
 
 		 613 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  30.13 
 
 		 648 aa  107  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  30.34 
 
 		 760 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  28.57 
 
 		 646 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.25 
 
 		 759 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  28.33 
 
 		 619 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  27.9 
 
 		 613 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.44 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  29.69 
 
 		 643 aa  106  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.63 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  28.44 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.04 
 
 		 731 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  29.91 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.23 
 
 		 669 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.43 
 
 		 687 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28 
 
 		 616 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  29.74 
 
 		 654 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.6 
 
 		 760 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.33 
 
 		 659 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  29.06 
 
 		 617 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.94 
 
 		 608 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.83 
 
 		 622 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.04 
 
 		 731 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.3 
 
 		 732 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  29.92 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.21 
 
 		 684 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  28.63 
 
 		 640 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.78 
 
 		 743 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  28.33 
 
 		 616 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.91 
 
 		 731 aa  104  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  28.63 
 
 		 656 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0819  cell division protein FtsH  29.46 
 
 		 639 aa  103  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  27.36 
 
 		 721 aa  103  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.8 
 
 		 653 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.76 
 
 		 610 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.76 
 
 		 602 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.46 
 
 		 639 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.89 
 
 		 610 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  29.26 
 
 		 673 aa  103  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.14 
 
 		 731 aa  103  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  30.2 
 
 		 703 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  28.94 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.6 
 
 		 783 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.39 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.75 
 
 		 638 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.17 
 
 		 604 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>