More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3219 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  94.41 
 
 		 680 aa  1323    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  56.23 
 
 		 677 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 680 aa  1396    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  41.09 
 
 		 676 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  42.41 
 
 		 668 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  37.06 
 
 		 686 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  33.87 
 
 		 698 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  31.67 
 
 		 655 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 773 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  33.54 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  31.65 
 
 		 672 aa  216  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  32.58 
 
 		 795 aa  213  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  32.92 
 
 		 771 aa  210  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  31.42 
 
 		 775 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  31.42 
 
 		 789 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  29.34 
 
 		 711 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  31.54 
 
 		 772 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  31.05 
 
 		 789 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  33.4 
 
 		 766 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  32.45 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  30.89 
 
 		 573 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  27.91 
 
 		 753 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 		 731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  25.6 
 
 		 640 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  26.08 
 
 		 703 aa  106  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  35.26 
 
 		 577 aa  91.7  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  25.42 
 
 		 699 aa  91.3  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.4 
 
 		 753 aa  89.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  24.47 
 
 		 721 aa  89.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  28.35 
 
 		 466 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  33.13 
 
 		 580 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  22.63 
 
 		 715 aa  89.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.5 
 
 		 757 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.69 
 
 		 723 aa  88.2  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  25.3 
 
 		 550 aa  88.2  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  31.47 
 
 		 744 aa  87.4  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  25.48 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.12 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  32.05 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.12 
 
 		 784 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  34.27 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  26.49 
 
 		 866 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.12 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  33.33 
 
 		 570 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  26.37 
 
 		 601 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  33.33 
 
 		 570 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  31.07 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  30.77 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  33.33 
 
 		 570 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  26.12 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.12 
 
 		 800 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  34.51 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.58 
 
 		 757 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.86 
 
 		 805 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  35.21 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.9 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.82 
 
 		 732 aa  84  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.21 
 
 		 570 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  29.58 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  33.8 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  23.59 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.97 
 
 		 804 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.89 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  31.98 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.04 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.49 
 
 		 739 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  31.76 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25 
 
 		 740 aa  81.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  33.13 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  35.92 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.13 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  34.29 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35 
 
 		 805 aa  81.3  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.88 
 
 		 742 aa  80.9  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.11 
 
 		 740 aa  80.9  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  31.76 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  34.21 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  34.97 
 
 		 810 aa  80.5  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  31.91 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  30.64 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.97 
 
 		 754 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  24.54 
 
 		 718 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  30.87 
 
 		 697 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  29.89 
 
 		 634 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.24 
 
 		 719 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  31.08 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.28 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  29.31 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  36.92 
 
 		 754 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  37.82 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.26 
 
 		 743 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  32.39 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.57 
 
 		 738 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  34.29 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  36.22 
 
 		 829 aa  79.7  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.85 
 
 		 756 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.82 
 
 		 718 aa  79.7  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  31.76 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>