More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3114 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 698 aa  1431    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  36.14 
 
 		 672 aa  411  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  35.7 
 
 		 655 aa  346  8e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  34.69 
 
 		 711 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 795 aa  333  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  34.64 
 
 		 775 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  36.3 
 
 		 771 aa  326  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  34.93 
 
 		 773 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  34.77 
 
 		 773 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  34.92 
 
 		 766 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  34.09 
 
 		 789 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  34.72 
 
 		 772 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  33.1 
 
 		 789 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  33.44 
 
 		 771 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  35.23 
 
 		 676 aa  270  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  28.29 
 
 		 640 aa  264  4e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  34.81 
 
 		 668 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  31.89 
 
 		 680 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  33.87 
 
 		 680 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  33.86 
 
 		 677 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  32.66 
 
 		 686 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  33.62 
 
 		 731 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  34.49 
 
 		 573 aa  213  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  29.2 
 
 		 753 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  28.71 
 
 		 866 aa  111  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  38.6 
 
 		 725 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.57 
 
 		 308 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  25.32 
 
 		 744 aa  97.8  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  35.25 
 
 		 1085 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  38.41 
 
 		 580 aa  94.4  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  38.41 
 
 		 569 aa  94  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  42.31 
 
 		 657 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  35.97 
 
 		 578 aa  90.9  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  42.31 
 
 		 653 aa  90.5  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  39.72 
 
 		 444 aa  90.1  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  39.02 
 
 		 787 aa  90.5  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  40.8 
 
 		 459 aa  90.1  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.77 
 
 		 772 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  38.89 
 
 		 450 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  36.62 
 
 		 387 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  38.89 
 
 		 448 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  34.48 
 
 		 441 aa  89  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  35.29 
 
 		 570 aa  88.2  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  42.28 
 
 		 445 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 		 662 aa  88.6  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  26.86 
 
 		 725 aa  88.6  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  36 
 
 		 450 aa  88.2  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  38.4 
 
 		 743 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.15 
 
 		 754 aa  88.2  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  33.09 
 
 		 1193 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  24.62 
 
 		 646 aa  87.8  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  36.69 
 
 		 577 aa  87.8  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  38.24 
 
 		 450 aa  87.4  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  38.21 
 
 		 432 aa  87.4  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  36.96 
 
 		 450 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  34.51 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  26.51 
 
 		 739 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  34.51 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 		 687 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  34.51 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  35.37 
 
 		 326 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  40.65 
 
 		 749 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  39.82 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  29.61 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.71 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  37.5 
 
 		 634 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  36.49 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  22.93 
 
 		 781 aa  85.5  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  35.71 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.34 
 
 		 755 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  32.34 
 
 		 646 aa  85.1  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.13 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  39.34 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  37.14 
 
 		 671 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  35.21 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  39.02 
 
 		 652 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  25.9 
 
 		 688 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  39.2 
 
 		 369 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  32.91 
 
 		 351 aa  83.6  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  33.56 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  37.04 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  24.94 
 
 		 703 aa  82.8  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 665 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  39.02 
 
 		 698 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  37.16 
 
 		 689 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  38.06 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.4 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.94 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  26.88 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.88 
 
 		 804 aa  81.6  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  31.79 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  36.13 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.85 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  37.86 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  36.29 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 		 468 aa  80.5  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  38.4 
 
 		 656 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.33 
 
 		 806 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>