More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2234 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  74.87 
 
 		 773 aa  1173    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  53.23 
 
 		 772 aa  793    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  76.92 
 
 		 771 aa  1181    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 766 aa  1570    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  50 
 
 		 789 aa  781    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  87.42 
 
 		 771 aa  1380    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  52.85 
 
 		 795 aa  775    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  51.99 
 
 		 775 aa  792    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  76.22 
 
 		 773 aa  1173    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  51.03 
 
 		 789 aa  793    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  37.88 
 
 		 711 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.92 
 
 		 698 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  35.18 
 
 		 672 aa  298  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  31.52 
 
 		 655 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  29.92 
 
 		 686 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  29.05 
 
 		 676 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  31.3 
 
 		 668 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  33.68 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  30.97 
 
 		 677 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 		 731 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  33.4 
 
 		 680 aa  197  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  32.41 
 
 		 680 aa  193  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  28.07 
 
 		 753 aa  190  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.58 
 
 		 640 aa  173  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.34 
 
 		 801 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.8 
 
 		 754 aa  102  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  35 
 
 		 662 aa  99.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.78 
 
 		 739 aa  99.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.56 
 
 		 754 aa  98.6  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.1 
 
 		 738 aa  98.6  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  28.28 
 
 		 550 aa  98.2  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.83 
 
 		 754 aa  97.4  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  41.48 
 
 		 725 aa  96.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.67 
 
 		 805 aa  95.9  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  37.34 
 
 		 1085 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  41.48 
 
 		 749 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.83 
 
 		 701 aa  95.9  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.13 
 
 		 719 aa  95.5  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.42 
 
 		 756 aa  95.5  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.36 
 
 		 704 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  39.68 
 
 		 744 aa  95.5  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.94 
 
 		 757 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  26.59 
 
 		 647 aa  94.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  30.17 
 
 		 577 aa  94  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.28 
 
 		 757 aa  94  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  42.06 
 
 		 743 aa  93.6  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  39.39 
 
 		 617 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  27.92 
 
 		 866 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.91 
 
 		 805 aa  93.2  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.48 
 
 		 755 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.17 
 
 		 718 aa  92.8  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  41.13 
 
 		 787 aa  92.4  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  32.28 
 
 		 656 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.55 
 
 		 763 aa  92.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  38.67 
 
 		 665 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  29.56 
 
 		 1193 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.51 
 
 		 754 aa  92  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  25.85 
 
 		 713 aa  92  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  41.13 
 
 		 305 aa  91.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  40.46 
 
 		 448 aa  91.3  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.54 
 
 		 740 aa  91.3  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  35.67 
 
 		 725 aa  91.3  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  38.27 
 
 		 639 aa  91.3  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  36.69 
 
 		 450 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 657 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.77 
 
 		 804 aa  90.9  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 653 aa  90.9  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  24.88 
 
 		 810 aa  90.1  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.75 
 
 		 740 aa  90.5  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.16 
 
 		 810 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  34.72 
 
 		 352 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  25.18 
 
 		 754 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  38.41 
 
 		 656 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  37.5 
 
 		 580 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  33.79 
 
 		 570 aa  89.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.23 
 
 		 742 aa  89.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  37.01 
 
 		 299 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  26.53 
 
 		 718 aa  89  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  37.96 
 
 		 478 aa  89  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  38.69 
 
 		 652 aa  89  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  26.52 
 
 		 699 aa  88.6  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.29 
 
 		 727 aa  88.6  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.25 
 
 		 578 aa  88.6  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.41 
 
 		 742 aa  88.6  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  42.28 
 
 		 687 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.33 
 
 		 738 aa  88.2  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  26.59 
 
 		 739 aa  87.8  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  40 
 
 		 441 aa  87.8  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.15 
 
 		 743 aa  87.8  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  26.85 
 
 		 746 aa  87.4  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.92 
 
 		 709 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  33.14 
 
 		 478 aa  87  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  40 
 
 		 634 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  26.2 
 
 		 646 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.54 
 
 		 721 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  38.06 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  36.5 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.76 
 
 		 801 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.54 
 
 		 806 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  37.12 
 
 		 569 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>