More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3559 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  56.08 
 
 		 680 aa  746    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 677 aa  1394    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  56.23 
 
 		 680 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  43.4 
 
 		 668 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  41.49 
 
 		 676 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  36.31 
 
 		 686 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  33.86 
 
 		 698 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 		 773 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  33.07 
 
 		 771 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  33.01 
 
 		 773 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  33.01 
 
 		 655 aa  234  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  33.98 
 
 		 672 aa  234  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  32.75 
 
 		 775 aa  224  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  32.31 
 
 		 711 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  31.26 
 
 		 771 aa  217  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  31.94 
 
 		 789 aa  213  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  30.81 
 
 		 789 aa  212  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  31.71 
 
 		 772 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  30.97 
 
 		 766 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  31.96 
 
 		 795 aa  201  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30.47 
 
 		 731 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  29.5 
 
 		 573 aa  144  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  28.24 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  25.87 
 
 		 640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  28.61 
 
 		 703 aa  100  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  25.6 
 
 		 550 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  35.84 
 
 		 448 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  25.3 
 
 		 713 aa  96.3  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.71 
 
 		 721 aa  93.2  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  34.27 
 
 		 466 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  25.76 
 
 		 803 aa  90.5  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.78 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  36.43 
 
 		 450 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  36.22 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  35.92 
 
 		 450 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  29.65 
 
 		 578 aa  89.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  32.87 
 
 		 744 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  27.99 
 
 		 699 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  26 
 
 		 552 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  25 
 
 		 1193 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  36.36 
 
 		 749 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  34.94 
 
 		 444 aa  87.8  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  35.92 
 
 		 450 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.65 
 
 		 730 aa  87.4  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.57 
 
 		 810 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  34.64 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.65 
 
 		 760 aa  86.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 		 450 aa  86.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.66 
 
 		 808 aa  86.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.14 
 
 		 805 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.42 
 
 		 805 aa  86.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  32.32 
 
 		 335 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  26.05 
 
 		 866 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.51 
 
 		 732 aa  86.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.27 
 
 		 723 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.27 
 
 		 781 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.58 
 
 		 738 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  34.87 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.63 
 
 		 804 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.12 
 
 		 739 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.82 
 
 		 801 aa  84.7  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 		 784 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  33.52 
 
 		 764 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  28.71 
 
 		 743 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  33.7 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.1 
 
 		 757 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.66 
 
 		 754 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.02 
 
 		 742 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  31.69 
 
 		 442 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.36 
 
 		 800 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.65 
 
 		 715 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  33.11 
 
 		 580 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  23.1 
 
 		 732 aa  83.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  26.08 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  24.57 
 
 		 826 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  33.83 
 
 		 570 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  32.97 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.56 
 
 		 740 aa  82.4  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.44 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.53 
 
 		 772 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  36.62 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  34.42 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  33.83 
 
 		 570 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  33.83 
 
 		 570 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.23 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.87 
 
 		 759 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  34.68 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  39.06 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  31.82 
 
 		 787 aa  82  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  32.62 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.72 
 
 		 742 aa  82  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  33.1 
 
 		 639 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.87 
 
 		 719 aa  82  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  31.61 
 
 		 1085 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.02 
 
 		 740 aa  81.6  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.11 
 
 		 755 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  32.97 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0024  AAA ATPase central domain protein  32.75 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  32.26 
 
 		 616 aa  81.6  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>