More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1879 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  100 
 
 		 787 aa  1604    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  44.51 
 
 		 743 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  39.53 
 
 		 744 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.75 
 
 		 639 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  37.92 
 
 		 680 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  37.21 
 
 		 689 aa  361  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  37.78 
 
 		 682 aa  361  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  39.5 
 
 		 653 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  36.62 
 
 		 656 aa  357  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  36.45 
 
 		 671 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  37.05 
 
 		 698 aa  350  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  37.85 
 
 		 657 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  37.92 
 
 		 656 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  35.52 
 
 		 697 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  35.62 
 
 		 634 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  35.49 
 
 		 665 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  35.51 
 
 		 725 aa  310  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  33.82 
 
 		 1085 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  34.93 
 
 		 687 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  41.16 
 
 		 788 aa  293  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  52.29 
 
 		 619 aa  278  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  34.74 
 
 		 697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 		 662 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 749 aa  270  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  34.02 
 
 		 1193 aa  270  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  38.79 
 
 		 652 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  34.16 
 
 		 646 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  47.47 
 
 		 450 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  38.77 
 
 		 432 aa  244  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  46.3 
 
 		 450 aa  244  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  39.33 
 
 		 448 aa  231  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  43.61 
 
 		 442 aa  230  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  41.05 
 
 		 450 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  47.35 
 
 		 444 aa  228  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  47.29 
 
 		 450 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  44.75 
 
 		 441 aa  226  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  40.54 
 
 		 434 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  47.67 
 
 		 445 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  40.7 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  38.27 
 
 		 448 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  41.31 
 
 		 478 aa  210  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  41.31 
 
 		 478 aa  209  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  30.4 
 
 		 622 aa  200  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  39.66 
 
 		 459 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  47.79 
 
 		 725 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 		 678 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  38.74 
 
 		 299 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  34.91 
 
 		 352 aa  144  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  54.03 
 
 		 134 aa  144  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  34.93 
 
 		 305 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.47 
 
 		 754 aa  132  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.59 
 
 		 754 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.93 
 
 		 754 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27 
 
 		 754 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  30 
 
 		 570 aa  125  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  33.59 
 
 		 387 aa  125  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.62 
 
 		 570 aa  124  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.62 
 
 		 570 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30.62 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.08 
 
 		 757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  33.94 
 
 		 443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.38 
 
 		 570 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.85 
 
 		 718 aa  118  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.62 
 
 		 569 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.22 
 
 		 721 aa  114  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  34.29 
 
 		 228 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  30.04 
 
 		 577 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.43 
 
 		 727 aa  110  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  26.78 
 
 		 810 aa  108  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.53 
 
 		 801 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.95 
 
 		 701 aa  107  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30 
 
 		 580 aa  107  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.29 
 
 		 723 aa  107  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.26 
 
 		 732 aa  107  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.56 
 
 		 763 aa  107  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  27 
 
 		 814 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.29 
 
 		 756 aa  106  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.53 
 
 		 730 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  24.75 
 
 		 703 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  25.34 
 
 		 703 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.88 
 
 		 736 aa  103  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  25.75 
 
 		 732 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  27.07 
 
 		 552 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.46 
 
 		 757 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.6 
 
 		 755 aa  101  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.32 
 
 		 808 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  25.31 
 
 		 806 aa  100  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  26.35 
 
 		 803 aa  100  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.76 
 
 		 759 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.02 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.57 
 
 		 781 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  31.66 
 
 		 607 aa  99.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.98 
 
 		 738 aa  99.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.33 
 
 		 391 aa  99.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.5 
 
 		 737 aa  99  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.57 
 
 		 784 aa  99  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.5 
 
 		 737 aa  99  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.11 
 
 		 800 aa  99  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  25.72 
 
 		 773 aa  98.6  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>