More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3602 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 448 aa  894    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  50.82 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  47.87 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  49.1 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  44.34 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  44.39 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  44.27 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  44.49 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  40.87 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  43.74 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  41.16 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  41.74 
 
 		 478 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  46.05 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  39.45 
 
 		 787 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  47.56 
 
 		 743 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  47.08 
 
 		 652 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  42.02 
 
 		 697 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  41.31 
 
 		 744 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  47.16 
 
 		 656 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  47.6 
 
 		 653 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  48.03 
 
 		 657 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  47.16 
 
 		 656 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  46.12 
 
 		 680 aa  192  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  45.85 
 
 		 1085 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  46.72 
 
 		 619 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  46.72 
 
 		 639 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  42.47 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  45.41 
 
 		 665 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  47.16 
 
 		 788 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  42.41 
 
 		 689 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  46.29 
 
 		 646 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  42.64 
 
 		 682 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  42.36 
 
 		 634 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  46.33 
 
 		 662 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  43.18 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  41.91 
 
 		 725 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  44.8 
 
 		 671 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  42.51 
 
 		 444 aa  173  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  39.38 
 
 		 1193 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 		 749 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  41.22 
 
 		 687 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  43.24 
 
 		 698 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  44.49 
 
 		 725 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  62.9 
 
 		 134 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  37.45 
 
 		 622 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  45.88 
 
 		 678 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  44.83 
 
 		 697 aa  149  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  31.47 
 
 		 570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  31.47 
 
 		 570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.47 
 
 		 570 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.12 
 
 		 570 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.92 
 
 		 569 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  33.2 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  36.71 
 
 		 578 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30.45 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.66 
 
 		 577 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  37.78 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  34.69 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.03 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  34.13 
 
 		 617 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  32.75 
 
 		 228 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  38.62 
 
 		 795 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  29.2 
 
 		 348 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  35.14 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  40.43 
 
 		 772 aa  98.2  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.89 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  36.49 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  39.01 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.51 
 
 		 308 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  29.58 
 
 		 367 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  32.8 
 
 		 573 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  27.08 
 
 		 326 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  35.92 
 
 		 789 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  37.09 
 
 		 775 aa  87.4  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  27.61 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  34.42 
 
 		 370 aa  87.4  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.95 
 
 		 493 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  31.25 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  30.93 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  38.06 
 
 		 766 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  32.93 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  37.76 
 
 		 655 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  35.82 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  37.06 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  30.61 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  34.72 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  30.58 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  36.2 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  35.37 
 
 		 771 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  34.81 
 
 		 771 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  35.86 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  36.62 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  28.25 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  38.06 
 
 		 773 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  33.56 
 
 		 698 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  38.06 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  31.89 
 
 		 711 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  32.35 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>