More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0127 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  61.71 
 
 		 178 aa  194  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  63.47 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  54.75 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  50.83 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 181 aa  164  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4188  hypothetical protein  55.28 
 
 		 169 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  52.6 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 257 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  47.32 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  38.29 
 
 		 198 aa  91.7  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  29.12 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  41.42 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  32.41 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 175 aa  84.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 201 aa  84.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
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NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
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