More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1405 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 236 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  32.81 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  32.57 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 262 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  36.98 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  31.06 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.39 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  26.6 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>