More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3089 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  100 
 
 
280 aa  545  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  50 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  44.48 
 
 
288 aa  203  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  40.47 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  43.86 
 
 
297 aa  183  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  41.99 
 
 
281 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  40.91 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.26 
 
 
290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  37.59 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.06 
 
 
304 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  37.8 
 
 
307 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  37.29 
 
 
300 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.98 
 
 
415 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  36.3 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.69 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  35.93 
 
 
301 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  35.47 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  47.55 
 
 
144 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
449 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  46.85 
 
 
152 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  28.28 
 
 
287 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 
274 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.97 
 
 
283 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
297 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.89 
 
 
291 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  33.44 
 
 
295 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  30.45 
 
 
289 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
297 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 
287 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.89 
 
 
303 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  35.31 
 
 
390 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  33.45 
 
 
291 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.99 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  42.04 
 
 
208 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  45.32 
 
 
144 aa  99.4  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  31.42 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  26.04 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.8 
 
 
180 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  40.41 
 
 
207 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  32.17 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  31.91 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.75 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.87 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  39.41 
 
 
169 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  44 
 
 
156 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  32.13 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  27.18 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  43.92 
 
 
150 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  44.52 
 
 
159 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
317 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  40 
 
 
155 aa  92.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.4 
 
 
158 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  28.57 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  33.78 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  42.86 
 
 
147 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  43.57 
 
 
156 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
148 aa  89.7  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.5 
 
 
149 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.33 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  41.43 
 
 
145 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  26.64 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  41.5 
 
 
153 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  39.1 
 
 
149 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.43 
 
 
152 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  37.01 
 
 
149 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  36.81 
 
 
142 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  29.31 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.16 
 
 
156 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.57 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  31.14 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
145 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  41.3 
 
 
153 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  26.76 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
145 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  29.24 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  41.61 
 
 
138 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  42.14 
 
 
148 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
145 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.32 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  39.26 
 
 
136 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  31.06 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  34.23 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  26.04 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.13 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  43.97 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  29.12 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  37.59 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.62 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  35.21 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  38.41 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>