More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5037 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 572 aa  1169    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.26 
 
 		 786 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  48.7 
 
 		 889 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  39.9 
 
 		 554 aa  324  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  34 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1150 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.27 
 
 		 1150 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.92 
 
 		 1152 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1152 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 547 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.84 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.54 
 
 		 1132 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.34 
 
 		 543 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.54 
 
 		 543 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 540 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.04 
 
 		 567 aa  179  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  29.76 
 
 		 632 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.63 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  29.76 
 
 		 632 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  29.76 
 
 		 632 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 696 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  29.46 
 
 		 552 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  29.46 
 
 		 632 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  29.46 
 
 		 632 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.67 
 
 		 623 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  29.46 
 
 		 653 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.82 
 
 		 583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.26 
 
 		 565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  28.55 
 
 		 578 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 591 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 591 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 591 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.05 
 
 		 557 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 578 aa  170  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 563 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 657 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.91 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 578 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  30.21 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.53 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.74 
 
 		 582 aa  143  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.16 
 
 		 593 aa  140  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.66 
 
 		 552 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.73 
 
 		 562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 564 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.4 
 
 		 535 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.87 
 
 		 551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  24.96 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.03 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  31.69 
 
 		 622 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 567 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  25.12 
 
 		 541 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 		 550 aa  104  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 1146 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  30.58 
 
 		 530 aa  98.2  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  23.9 
 
 		 534 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.66 
 
 		 534 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  25.34 
 
 		 544 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  30.19 
 
 		 549 aa  94  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.49 
 
 		 534 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.49 
 
 		 534 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  25.3 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  24.21 
 
 		 547 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  26.11 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.74 
 
 		 562 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.1 
 
 		 527 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  25.47 
 
 		 543 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 489 aa  87  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.83 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  25.43 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.05 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.87 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  24.74 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  22.56 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.96 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.1 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  22.53 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.21 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.15 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.06 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  35.34 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.34 
 
 		 573 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.81 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.3 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.9 
 
 		 515 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.1 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.64 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.08 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.28 
 
 		 592 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.57 
 
 		 592 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  27.49 
 
 		 591 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  27.49 
 
 		 591 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>