More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0956 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 323 aa  671    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  33.44 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  30.74 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  29.75 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  29.28 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  32.89 
 
 		 379 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  30.84 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  25.82 
 
 		 394 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.7 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.53 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.56 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.48 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.96 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  31 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.21 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 373 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.63 
 
 		 379 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.42 
 
 		 391 aa  89  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  32.18 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.92 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  26.06 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.15 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.63 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  28.48 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.82 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  29.94 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.61 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.06 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.32 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.4 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.18 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.17 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.08 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.65 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.67 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.84 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  27.03 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.86 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.71 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.32 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.71 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.94 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.47 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  27.69 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.12 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  23.58 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  26.6 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.89 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.89 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.35 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.99 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.46 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.08 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.14 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  24.58 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.3 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.05 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  30.51 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.17 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.28 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.78 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.81 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  22.97 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  26.06 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.58 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  27.86 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  24.92 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.18 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.3 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  32.45 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.86 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  24.57 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  24.24 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  26.8 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  24.57 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  21.59 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  25.1 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  24.22 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.44 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.33 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  31.17 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  24.12 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.2 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>