More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3247 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  96.79 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  86.1 
 
 		 187 aa  344  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  86.02 
 
 		 188 aa  323  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  73.12 
 
 		 188 aa  288  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  72.58 
 
 		 188 aa  287  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 187 aa  279  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 187 aa  259  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  37.77 
 
 		 199 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  37.77 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 292 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 176 aa  98.6  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  97.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 180 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 180 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  31.75 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 180 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  29.73 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 276 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  32.02 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 209 aa  91.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  29.51 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 189 aa  91.3  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 208 aa  90.9  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  30.05 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  27.87 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  31.32 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  27.32 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  29.19 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  34.07 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  88.6  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.95 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  30.34 
 
 		 224 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 292 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>