More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2303 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
512 aa  1034    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 
507 aa  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 
492 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 
501 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.45 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 
505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  26.8 
 
 
449 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  24.94 
 
 
637 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.72 
 
 
489 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.95 
 
 
490 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 
489 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
362 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.45 
 
 
475 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.52 
 
 
489 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 
361 aa  95.1  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 
304 aa  94.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  24.08 
 
 
495 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 
325 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  25.42 
 
 
368 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 
280 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  22.49 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 
362 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 
338 aa  86.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 
406 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  20.49 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.17 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 
393 aa  84  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.59 
 
 
492 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  24.73 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  21.6 
 
 
508 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 
286 aa  79.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  24.78 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  21.18 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 
401 aa  77  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  22.45 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  24.64 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 
287 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  21.01 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  23.64 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24.63 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 
685 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  25.25 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  22.19 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.2 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 
636 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 
636 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 
840 aa  73.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  24.49 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  25.67 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  25.67 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 
304 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  25.81 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.09 
 
 
485 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
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NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.29 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal 
 
 
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NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  31.33 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
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NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
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NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  27.42 
 
 
813 aa  70.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.183155 
 
 
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NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  23.92 
 
 
460 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  34.85 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
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