More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2001 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 796 aa  1644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  95.09 
 
 		 796 aa  1554    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.18 
 
 		 819 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 859 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 		 849 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 		 853 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.53 
 
 		 955 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 955 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.75 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 		 1079 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 962 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 845 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 777 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.26 
 
 		 1176 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 845 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1102 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1106 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 		 769 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 		 753 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 1108 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1260 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 		 994 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.21 
 
 		 1180 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  40.57 
 
 		 1015 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 1113 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 752 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1260 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 1134 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  47.38 
 
 		 726 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  41.21 
 
 		 1112 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 673 aa  360  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 657 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1279 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 773 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 		 1322 aa  351  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 1132 aa  351  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 		 844 aa  350  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 692 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.63 
 
 		 645 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  44.1 
 
 		 726 aa  348  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 650 aa  347  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 677 aa  346  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 		 740 aa  346  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 692 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 		 766 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 936 aa  343  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  45.88 
 
 		 733 aa  343  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 773 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  44.16 
 
 		 525 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1051 aa  340  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  47.41 
 
 		 824 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1148 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 		 656 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 741 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  45.58 
 
 		 654 aa  337  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 639 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 668 aa  335  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 983 aa  335  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.39 
 
 		 925 aa  333  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 823 aa  333  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 		 736 aa  331  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1076 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1215 aa  330  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  33.72 
 
 		 749 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  32.5 
 
 		 1065 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 661 aa  327  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 1124 aa  327  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  45.33 
 
 		 654 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  32.86 
 
 		 1561 aa  326  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 941 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 828 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 673 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 		 522 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 637 aa  324  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 818 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1065 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 1053 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 642 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1092 aa  321  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.92 
 
 		 663 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  35.75 
 
 		 1086 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  43.92 
 
 		 416 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 641 aa  320  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1105 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  43 
 
 		 527 aa  319  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  42.86 
 
 		 646 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 		 664 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 		 743 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 642 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 711 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 810 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 812 aa  317  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 939 aa  317  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 926 aa  317  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.93 
 
 		 814 aa  317  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 953 aa  317  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.92 
 
 		 933 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 789 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 807 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  42.82 
 
 		 594 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>