More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1479 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  808    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  47.17 
 
 
413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
413 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  46.09 
 
 
416 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  38.24 
 
 
418 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
426 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  36.32 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.1 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  31.54 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  31.35 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  31.13 
 
 
447 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  35.16 
 
 
405 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  29.78 
 
 
452 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.81 
 
 
433 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  29.61 
 
 
443 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.3 
 
 
444 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.53 
 
 
453 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  28.78 
 
 
441 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.53 
 
 
440 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  28.69 
 
 
441 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.69 
 
 
438 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  30.21 
 
 
449 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.86 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  30.24 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.63 
 
 
430 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  28.07 
 
 
467 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.07 
 
 
465 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.07 
 
 
470 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.81 
 
 
465 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.81 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  27.81 
 
 
467 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  26.95 
 
 
440 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  28.99 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  28.99 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  27.07 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  28.1 
 
 
441 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  31.59 
 
 
418 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.32 
 
 
506 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  25.9 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.2 
 
 
475 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.71 
 
 
443 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
420 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.35 
 
 
433 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  27.11 
 
 
423 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  25.74 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  27.08 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  25.07 
 
 
457 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  25.07 
 
 
457 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  26.62 
 
 
426 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
413 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  24.27 
 
 
437 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.16 
 
 
461 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  26.42 
 
 
424 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  25.62 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  27.88 
 
 
424 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  25.45 
 
 
450 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  37.36 
 
 
578 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
410 aa  109  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  25.71 
 
 
422 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  25.94 
 
 
457 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  25.33 
 
 
442 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  22.74 
 
 
432 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
405 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  28.77 
 
 
456 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  25.4 
 
 
421 aa  106  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
427 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.69 
 
 
437 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
427 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  23.95 
 
 
454 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  25.92 
 
 
461 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  30.4 
 
 
432 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.89 
 
 
428 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  25.99 
 
 
461 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.99 
 
 
435 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  25.77 
 
 
426 aa  103  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  24.28 
 
 
490 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.64 
 
 
432 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  25.07 
 
 
457 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  26.6 
 
 
454 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  27.76 
 
 
442 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  26.87 
 
 
449 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  26.55 
 
 
464 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.74 
 
 
440 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.74 
 
 
440 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  26.61 
 
 
443 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  29.17 
 
 
447 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
416 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
422 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>