More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2059 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 375 aa  753    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  43.16 
 
 		 377 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  43.22 
 
 		 385 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  43.22 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  41 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  41.1 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  39.11 
 
 		 386 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  39.47 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 		 363 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  37.63 
 
 		 382 aa  252  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  39.11 
 
 		 392 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  36.53 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  39.5 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  38.97 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  41.01 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  41.01 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  36 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  34.67 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  35.84 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  37.23 
 
 		 378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  37.29 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  33.95 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  36.93 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  38.39 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  36.63 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  39.13 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  34.85 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  34.85 
 
 		 374 aa  206  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  36.8 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  35.69 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  38.12 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  34.89 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  37.46 
 
 		 472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  34.22 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  33.87 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  34.65 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  36.25 
 
 		 480 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  34.05 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  31.89 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  33.78 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  36.07 
 
 		 426 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.06 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  32.95 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  34.2 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.69 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  34 
 
 		 517 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  31.1 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  34.22 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.43 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 496 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  34.68 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  35.38 
 
 		 512 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 378 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 592 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  31.52 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  31.12 
 
 		 539 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  29.24 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3147  hypothetical protein  28.89 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.64 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  29.66 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0752  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>