More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1725 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1725  porin  100 
 
 		 348 aa  701    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  74.43 
 
 		 348 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  40.37 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  39.85 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  40.67 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  38.6 
 
 		 426 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  37.53 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  38.11 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  39 
 
 		 414 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  38.76 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  37.82 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  38.52 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  37.54 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  39.45 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  36.54 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  36.03 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  39.73 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  33.16 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  36.27 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  36.02 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  38.11 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  36.44 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  35.54 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  36.16 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  35.04 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.14 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  34.37 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  33.63 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  32.07 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.61 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  31.95 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  33.71 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.55 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.19 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  35.65 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  31.61 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  31.51 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.71 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.71 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  31.07 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  32.61 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  32.22 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.33 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  29.34 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  30.51 
 
 		 380 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  29.49 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  33.42 
 
 		 383 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  34.19 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  33.92 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  30.77 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  33.42 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.2 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  31.92 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  29.06 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  29.06 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  32.46 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.2 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  31.02 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  32.83 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.38 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  30.12 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.17 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  32.66 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.78 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  32.83 
 
 		 380 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  31.89 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  32.53 
 
 		 380 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  28.77 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  28.41 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  28.42 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  29.55 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  30.89 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  31.93 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  31.04 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  28.42 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  30.79 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  32.15 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  30.62 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  29.97 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  29.97 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  30.03 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  30.52 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  30.52 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  29.97 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  30.35 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  30.55 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  29.03 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  30.4 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  28.57 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  29.74 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  32.53 
 
 		 379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  30.25 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  28.8 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  40.5 
 
 		 383 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  34.67 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  30.57 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.29 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  28.81 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  30.97 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>