130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2621 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  100 
 
 
382 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  45.83 
 
 
376 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  27.25 
 
 
403 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  28.25 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  29.2 
 
 
385 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  31.43 
 
 
356 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  26.86 
 
 
384 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  31.68 
 
 
396 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  27.14 
 
 
395 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  26.32 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  28.85 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  32.3 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  26.75 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.92 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.92 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  32.87 
 
 
147 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  29.83 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.32 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.77 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  29.27 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.81 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  24.03 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.03 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.23 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  25.21 
 
 
471 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  25.24 
 
 
411 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  27.27 
 
 
397 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.36 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.47 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.47 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  22.75 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.75 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  23.65 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  22.82 
 
 
473 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.63 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  24.89 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  25 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  24.89 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  28.32 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  28.32 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.69 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  21.66 
 
 
369 aa  56.2  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  27.96 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  25.94 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  24.48 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  25.59 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  22.89 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  29.26 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.6 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  27.5 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.13 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  24.57 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.19 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  31.01 
 
 
190 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.15 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  30.08 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  24.52 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.06 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  26.12 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.77 
 
 
392 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  32.09 
 
 
400 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  32.86 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.81 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  23.95 
 
 
388 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  28.49 
 
 
470 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  26.86 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  23.35 
 
 
354 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  20.61 
 
 
404 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.08 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.44 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  25 
 
 
430 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  25.09 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.09 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  24.64 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.65 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  28.82 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  21.91 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  23.65 
 
 
513 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  23.08 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  23.19 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  21.74 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  25 
 
 
273 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1863  integrase family protein  24.88 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  31.94 
 
 
366 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.71 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  24.03 
 
 
446 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  24.03 
 
 
446 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  23.77 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.35 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  24.03 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  32.58 
 
 
401 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.46 
 
 
159 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  22.54 
 
 
392 aa  47  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  25.58 
 
 
304 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  23.42 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.76 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  28.15 
 
 
531 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  22.42 
 
 
368 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6370  integrase family protein  24.65 
 
 
438 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>