More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2785 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  100 
 
 		 372 aa  777    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  49.15 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  48.86 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  48.58 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  42.74 
 
 		 357 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  37.03 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  36.64 
 
 		 335 aa  239  8e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  34.42 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  31.01 
 
 		 363 aa  205  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  31.41 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  31.79 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  30.29 
 
 		 337 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.73 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  32.19 
 
 		 556 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.29 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  28.61 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.28 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.86 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  27.04 
 
 		 617 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  29.19 
 
 		 319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.51 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.76 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.82 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.52 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  27.38 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.02 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  29.2 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.35 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.21 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.58 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.04 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  25.72 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  24.71 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  26.14 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  25.86 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  24.67 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  24.21 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.5 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  23.13 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  24.09 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  23.78 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  27.14 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  24.36 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  26.86 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  24.35 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.62 
 
 		 310 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  22.48 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  22.48 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  26.52 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  23.68 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  22.8 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  26.5 
 
 		 314 aa  97.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  23.59 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  25.4 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  23.1 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  22.51 
 
 		 354 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  21.82 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  24.36 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  25.36 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  22.99 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  23.36 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  21.82 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  25.22 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  22.7 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  24.32 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  24.13 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  21.81 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  21.65 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  21.81 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  23.36 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  23.45 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  21.81 
 
 		 355 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  23.26 
 
 		 354 aa  90.5  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  23.76 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  23.76 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  23.76 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  23.76 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  22.77 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>