More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1145 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  61.47 
 
 		 1124 aa  1370    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  51.71 
 
 		 1146 aa  1148    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  52.7 
 
 		 1143 aa  1192    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  61.3 
 
 		 1134 aa  1395    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1191 aa  2431    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  40.35 
 
 		 1165 aa  861    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1092 aa  628  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 		 1043 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1069 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1050 aa  485  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1057 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.4 
 
 		 1052 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1011 aa  446  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1038 aa  432  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  29.02 
 
 		 1024 aa  429  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1044 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  39.06 
 
 		 1290 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1044 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.25 
 
 		 1496 aa  416  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1470 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.61 
 
 		 1032 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1032 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1063 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1041 aa  413  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1189 aa  412  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1034 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.99 
 
 		 1049 aa  410  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1071 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1038 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1038 aa  406  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1059 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1058 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1043 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1039 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1028 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1047 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1028 aa  390  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1028 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1028 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1034 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1039 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1034 aa  382  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1058 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1020 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1036 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1038 aa  379  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1053 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.65 
 
 		 1036 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1055 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1026 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1065 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1041 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1046 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1043 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.2 
 
 		 1050 aa  366  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1173 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1040 aa  362  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1014 aa  361  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1075 aa  359  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.76 
 
 		 1069 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1052 aa  356  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1017 aa  356  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.64 
 
 		 1024 aa  353  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1121 aa  353  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1035 aa  352  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1095 aa  352  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.54 
 
 		 1081 aa  348  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1006 aa  348  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1028 aa  347  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  26.62 
 
 		 1052 aa  346  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1067 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.76 
 
 		 1031 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1101 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1031 aa  345  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1031 aa  345  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1031 aa  345  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1031 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1031 aa  344  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1048 aa  344  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1042 aa  343  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1031 aa  343  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1067 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1067 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1033 aa  342  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1095 aa  341  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1063 aa  341  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1040 aa  340  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1020 aa  340  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1031 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1067 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1031 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1031 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1073 aa  338  2.9999999999999997e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.71 
 
 		 1068 aa  338  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1070 aa  338  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1031 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1064 aa  338  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1082 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1046 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1026 aa  337  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>