More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1562 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  100 
 
 		 1296 aa  2679    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.3 
 
 		 1363 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25.66 
 
 		 1397 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  26.55 
 
 		 1370 aa  377  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26.68 
 
 		 1340 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.55 
 
 		 1374 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  26.09 
 
 		 1334 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  25.94 
 
 		 1355 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  25.59 
 
 		 1374 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  26.34 
 
 		 1316 aa  361  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  24.73 
 
 		 1378 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  24.78 
 
 		 1327 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  25.35 
 
 		 1342 aa  357  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  24.91 
 
 		 1373 aa  342  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  25.87 
 
 		 1384 aa  340  8e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  26.33 
 
 		 1366 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  24.76 
 
 		 1349 aa  337  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  25.56 
 
 		 1313 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  25.07 
 
 		 1355 aa  330  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  25.76 
 
 		 1373 aa  325  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  25.15 
 
 		 1388 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  24.29 
 
 		 1418 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.56 
 
 		 1306 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  25.29 
 
 		 1378 aa  319  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  24.89 
 
 		 1400 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  24.86 
 
 		 1347 aa  303  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  24.48 
 
 		 1335 aa  301  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  23.1 
 
 		 1374 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  24.96 
 
 		 1324 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  28.21 
 
 		 1343 aa  290  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  23.47 
 
 		 1347 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.28 
 
 		 1414 aa  282  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  24.62 
 
 		 1298 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  23.65 
 
 		 1278 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  29.34 
 
 		 1404 aa  265  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 904 aa  265  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  26.08 
 
 		 1311 aa  258  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  26.2 
 
 		 1344 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  25.28 
 
 		 1376 aa  251  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.27 
 
 		 1526 aa  247  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 940 aa  247  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  28.81 
 
 		 1366 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 934 aa  241  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 1341 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  28.87 
 
 		 961 aa  226  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  30.06 
 
 		 663 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 677 aa  212  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  27.82 
 
 		 993 aa  204  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  22.62 
 
 		 1407 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.66 
 
 		 1396 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  23.73 
 
 		 1070 aa  194  7e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 		 668 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  28.66 
 
 		 876 aa  189  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1390 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1390 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1390 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 1383 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1118 aa  181  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.23 
 
 		 1118 aa  180  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 1361 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 1140 aa  179  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  28.5 
 
 		 919 aa  178  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 1383 aa  177  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 1559 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 1172 aa  177  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 1153 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 1385 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  22.04 
 
 		 1175 aa  177  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1426 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 837 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 1013 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 1248 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  22.36 
 
 		 1105 aa  175  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00426  putative two-component system sensor kinase/response regulator fusion protein  25.88 
 
 		 1280 aa  175  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 1010 aa  174  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  30.55 
 
 		 1202 aa  174  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.36 
 
 		 1070 aa  171  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  32.21 
 
 		 1156 aa  171  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  22.66 
 
 		 1346 aa  171  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1131 aa  171  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  21.33 
 
 		 1191 aa  171  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 1002 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.13 
 
 		 1051 aa  169  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  23.88 
 
 		 921 aa  168  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 		 1130 aa  168  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1287 aa  168  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  20.53 
 
 		 1181 aa  167  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1406 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 		 1651 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 1711 aa  166  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 		 1133 aa  165  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 1048 aa  164  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1646 aa  164  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 		 1258 aa  164  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  27.96 
 
 		 1299 aa  163  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 		 1180 aa  163  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 1631 aa  163  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 1431 aa  162  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  28.13 
 
 		 1427 aa  161  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 1645 aa  161  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>