152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1249 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
686 aa  1409  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.27885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  74.36 
 
 
707 aa  1085  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.61631e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  38.54 
 
 
757 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  48.82 
 
 
526 aa  469  1e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.24089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  48.91 
 
 
563 aa  459  1e-128  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
730 aa  441  1e-122  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  38.08 
 
 
736 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  39 
 
 
725 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 
961 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  36.29 
 
 
984 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
739 aa  416  1e-115  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.78 
 
 
887 aa  407  1e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  35.86 
 
 
928 aa  408  1e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  36.33 
 
 
949 aa  407  1e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.96 
 
 
985 aa  400  1e-110  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  38.02 
 
 
1369 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  36.64 
 
 
1759 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  35.9 
 
 
715 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 
742 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  37.2 
 
 
846 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
710 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  34.72 
 
 
778 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  35.03 
 
 
737 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  33.38 
 
 
789 aa  363  6e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  36.96 
 
 
880 aa  359  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.95 
 
 
854 aa  340  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  34.24 
 
 
794 aa  336  8e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  36.46 
 
 
990 aa  328  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  34.08 
 
 
894 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 
611 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  36.38 
 
 
847 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
1137 aa  286  9e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  31.87 
 
 
1017 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  30.94 
 
 
2042 aa  163  8e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  31.86 
 
 
978 aa  163  8e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  28.54 
 
 
590 aa  151  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
649 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  23.81 
 
 
646 aa  76.6  1e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  25.45 
 
 
885 aa  75.9  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  26.26 
 
 
874 aa  70.9  7e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  22.88 
 
 
537 aa  69.3  2e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
1224 aa  66.2  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.04 
 
 
867 aa  64.7  5e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  62.07 
 
 
584 aa  63.9  8e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  41.86 
 
 
534 aa  62.8  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  51.67 
 
 
298 aa  62.4  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.69346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  51.85 
 
 
552 aa  61.6  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  46.25 
 
 
539 aa  61.6  5e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  52.63 
 
 
460 aa  60.1  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  21.83 
 
 
621 aa  60.1  1e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  53.12 
 
 
833 aa  60.1  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  21.9 
 
 
591 aa  60.1  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  50.77 
 
 
861 aa  59.7  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  47.89 
 
 
873 aa  59.7  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  25.27 
 
 
571 aa  59.7  2e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  53.23 
 
 
308 aa  58.9  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  49.12 
 
 
391 aa  58.2  5e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  46.67 
 
 
477 aa  58.2  6e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.71564e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
524 aa  57.8  6e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
639 aa  57.8  6e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
741 aa  57.8  7e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  49.18 
 
 
577 aa  57.8  7e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.40761e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  52.63 
 
 
722 aa  57.4  8e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  39.81 
 
 
475 aa  57.4  9e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 
1601 aa  57.4  9e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  38.78 
 
 
535 aa  56.6  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.67 
 
 
1209 aa  56.2  2e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  47.89 
 
 
583 aa  56.2  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.98696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  22.55 
 
 
623 aa  55.8  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  49.21 
 
 
532 aa  56.2  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.33 
 
 
927 aa  56.6  2e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  26.67 
 
 
906 aa  55.8  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  54.55 
 
 
295 aa  56.6  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  48.39 
 
 
780 aa  55.5  3e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  47.46 
 
 
683 aa  55.8  3e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  38.46 
 
 
554 aa  55.5  3e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  25.73 
 
 
578 aa  55.1  4e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.28 
 
 
537 aa  54.7  5e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  47.22 
 
 
536 aa  55.1  5e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  49.23 
 
 
490 aa  54.7  6e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  23.09 
 
 
587 aa  54.3  7e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  46.27 
 
 
604 aa  53.9  9e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  48.21 
 
 
533 aa  53.9  9e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  50.88 
 
 
746 aa  53.9  9e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  41.54 
 
 
423 aa  53.9  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 
895 aa  53.9  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  43.66 
 
 
951 aa  53.9  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  49.15 
 
 
563 aa  53.5  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.15938e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28 
 
 
582 aa  53.9  1e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  43.1 
 
 
477 aa  53.1  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
591 aa  53.1  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 
580 aa  52.8  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 
965 aa  53.1  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  42.47 
 
 
541 aa  53.1  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  34.68 
 
 
955 aa  52.8  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.94 
 
 
375 aa  52.8  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  23.01 
 
 
815 aa  52  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  45.9 
 
 
412 aa  52  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  45 
 
 
469 aa  52.4  3e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.67445e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.07 
 
 
567 aa  51.6  4e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>