More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1713 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  100 
 
 		 631 aa  1306    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 658 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  39.72 
 
 		 638 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  38.05 
 
 		 656 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.56 
 
 		 630 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  37.43 
 
 		 640 aa  317  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.98 
 
 		 641 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  34.04 
 
 		 620 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.26 
 
 		 694 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.4 
 
 		 670 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  32.46 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.54 
 
 		 673 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  32.04 
 
 		 669 aa  236  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.66 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 		 671 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  33.27 
 
 		 712 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.38 
 
 		 626 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 704 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  31.47 
 
 		 510 aa  208  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  29.59 
 
 		 673 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.84 
 
 		 668 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  31.08 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  29.46 
 
 		 672 aa  186  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.98 
 
 		 648 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.44 
 
 		 679 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  28.87 
 
 		 903 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.05 
 
 		 710 aa  171  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 653 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  29.75 
 
 		 519 aa  165  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.8 
 
 		 656 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.64 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  26.62 
 
 		 666 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  28.26 
 
 		 665 aa  144  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.73 
 
 		 643 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40.94 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  28.51 
 
 		 642 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  29.49 
 
 		 677 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  27.7 
 
 		 660 aa  128  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  26.06 
 
 		 650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  25.3 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 		 798 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  34.67 
 
 		 412 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  35.61 
 
 		 1313 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  27.8 
 
 		 645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 594 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  25.05 
 
 		 757 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  33.48 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  24.81 
 
 		 630 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 427 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  35.03 
 
 		 316 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  31.6 
 
 		 712 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27.66 
 
 		 734 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  29.04 
 
 		 813 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  38.33 
 
 		 505 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 270 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.86 
 
 		 407 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 189 aa  97.1  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  44.04 
 
 		 269 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 262 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  33.33 
 
 		 239 aa  94.7  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  44.04 
 
 		 269 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 261 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.85 
 
 		 296 aa  94.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 361 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 263 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 263 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 270 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  33.75 
 
 		 778 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 270 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 270 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 286 aa  92.8  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 263 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 		 306 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  42.34 
 
 		 264 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 459 aa  91.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  32.87 
 
 		 263 aa  91.3  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.06 
 
 		 320 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 		 270 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  28.4 
 
 		 300 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  38.26 
 
 		 398 aa  90.9  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 241 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  40.34 
 
 		 271 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  32.63 
 
 		 471 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  39.5 
 
 		 271 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.56 
 
 		 330 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 260 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  43.56 
 
 		 334 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  42.31 
 
 		 464 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  41.28 
 
 		 270 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.58 
 
 		 320 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.5 
 
 		 424 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 727 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 344 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  34.13 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  34.13 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  34.95 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>