70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1770 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 316 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  51.59 
 
 		 300 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  30.45 
 
 		 789 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  31.44 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.62 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  29.81 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.66 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  30.49 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  35.03 
 
 		 631 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.8 
 
 		 640 aa  95.9  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 673 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 		 658 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  30 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.54 
 
 		 631 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 630 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  32.45 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  27.66 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.16 
 
 		 641 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 		 704 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  29.69 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.07 
 
 		 712 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.55 
 
 		 673 aa  72.8  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.54 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  28.36 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  29.1 
 
 		 669 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  24.37 
 
 		 670 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.96 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  34.44 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 613 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  32.81 
 
 		 594 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  32.35 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  28.46 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  27.93 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  25 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  36.99 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 		 813 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  40 
 
 		 665 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  29.95 
 
 		 798 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  43.04 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  27.21 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  27.45 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  25.63 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 		 712 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 642 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  29.05 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  26.83 
 
 		 645 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  27.06 
 
 		 504 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  30.43 
 
 		 648 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  27.13 
 
 		 620 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 660 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  27.72 
 
 		 668 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27 
 
 		 734 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  25.82 
 
 		 672 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  29.59 
 
 		 903 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  25 
 
 		 517 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  36.23 
 
 		 586 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 		 648 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.95 
 
 		 656 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  40.3 
 
 		 471 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.17 
 
 		 630 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>