104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6874 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 366 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  78.2 
 
 		 363 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  45.78 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  28.47 
 
 		 298 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  27.76 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.15 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  26.41 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  29.49 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  24.9 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  28.44 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  26.73 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  35.46 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  32.73 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  24.24 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.93 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  25.98 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  31.93 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  24.8 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  27.09 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  29.45 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.93 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  31.93 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  31.93 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  31.93 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  31.93 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  30.72 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  30.72 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  25.85 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  32.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  32.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  32.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  32.09 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  32.09 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  25.52 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  32.09 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  31.52 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  25.82 
 
 		 345 aa  53.1  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  27.78 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  27.94 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.61 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  28.77 
 
 		 271 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  34.13 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  26.14 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  31.06 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  31.06 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  31.06 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  27.46 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  33.86 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  29.17 
 
 		 307 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  24 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  31.06 
 
 		 279 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  24 
 
 		 274 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  27.46 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  23.2 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  32.14 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  24.42 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  26.34 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  25.97 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  29.3 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  29.94 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.11 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  25.38 
 
 		 275 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  29.5 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  22.09 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  30.57 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  27.39 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  27.39 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  26.41 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  27.39 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  23.53 
 
 		 296 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  25.79 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  25.1 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.5 
 
 		 283 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  27.78 
 
 		 342 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  34.25 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  26.07 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  29.19 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  30.15 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  29.38 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  25.14 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  22.94 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  28.08 
 
 		 262 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  22.4 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  28.47 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  29.63 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  25.1 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.77 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  29.63 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  25 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  28.82 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  26.32 
 
 		 269 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  36.51 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  28.89 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>