135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4660 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  91.69 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  91.69 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  91.69 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  63.47 
 
 		 313 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  66.99 
 
 		 301 aa  351  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  66.34 
 
 		 299 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  66.67 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  66.01 
 
 		 299 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  66.01 
 
 		 299 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  66.01 
 
 		 299 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  66.01 
 
 		 299 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  69.03 
 
 		 311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  66.01 
 
 		 299 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  67.57 
 
 		 292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  51.86 
 
 		 316 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  52.17 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  40 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  42.27 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  42.27 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  39.47 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  37.45 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  36.36 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  32.12 
 
 		 363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  34.66 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  34.66 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  45.58 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  34.88 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  31.44 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  36 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  35.86 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  30.88 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  29.01 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  34.05 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.53 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  33.6 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  28.61 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  31.38 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  30.08 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  30.92 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  31.4 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  26.42 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  30.26 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  30.05 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  30.05 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  30.05 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  27.17 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  29.33 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  31.69 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.84 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.44 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  31.47 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  29.2 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  30.91 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  30.72 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  28.91 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  28.62 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  31.05 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  30.6 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  30.6 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  23.53 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  27.2 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  27.2 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  29.62 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  31.58 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  31.14 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  29.02 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  32.67 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  29.36 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  26.78 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  29.46 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  31.51 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  27.24 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  22.99 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  25.2 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  28.19 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  30 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  31.74 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  30.24 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  25.96 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  31.52 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  30.09 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  29.09 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  33.59 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  25.98 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  29.34 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  31.2 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  32.26 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  35.11 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.42 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  35.25 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  28.2 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  26.9 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  25.32 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  29.09 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  33.61 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  33.8 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>