More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0046 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  42.94 
 
 
180 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.77 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.97 
 
 
171 aa  87  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.08 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.21 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.44 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.72 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.48 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.33 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.54 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.16 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.33 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.11 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  34.03 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.58 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.33 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.05 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.05 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  35 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.3 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.9 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.92 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.94 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  28.17 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.06 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.77 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  26.62 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.67 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.68 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  31.82 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.08 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.78 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.76 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.25 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.16 
 
 
278 aa  64.3  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.51 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.78 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.8 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.45 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.5 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  28.17 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.63 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  32.45 
 
 
173 aa  61.6  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  24.03 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.73 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.11 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.49 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  26.9 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.74 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  28.74 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  29.87 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.32 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.79 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  30.57 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  27.84 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  27.85 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  27.84 
 
 
257 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.39 
 
 
169 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.57 
 
 
188 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  30.14 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.02 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.3 
 
 
169 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  32 
 
 
202 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  28.21 
 
 
363 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  27.86 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  26.7 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.84 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  28.74 
 
 
263 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.96 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  26.62 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  30.15 
 
 
274 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.81 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  29.56 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  29.56 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.11 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.22 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  25.18 
 
 
171 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  25.18 
 
 
171 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.38 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.87 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  25.69 
 
 
169 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  30.46 
 
 
169 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.6 
 
 
248 aa  55.1  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  29.2 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  28.06 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.21 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.12 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.03 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.25 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.06 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.02 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  27.46 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.53 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  31.85 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  24.18 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  27.78 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  24.84 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>