More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0127 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0127  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 551 aa  1074    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  33.57 
 
 		 811 aa  317  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  33.94 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  34.98 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  34.43 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 562 aa  280  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 574 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  34.58 
 
 		 586 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 569 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 569 aa  277  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  32.64 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  32.56 
 
 		 579 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  32.96 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  33.4 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  33.14 
 
 		 593 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  32.77 
 
 		 570 aa  270  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  32.76 
 
 		 597 aa  269  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  31.13 
 
 		 568 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  31.13 
 
 		 568 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  31.13 
 
 		 568 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  32.58 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  32.58 
 
 		 570 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  31.82 
 
 		 570 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  32.62 
 
 		 720 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  30.98 
 
 		 592 aa  267  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  31.38 
 
 		 573 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  32.57 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  31.42 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  31.02 
 
 		 561 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  32.44 
 
 		 558 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  30.73 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  31.02 
 
 		 561 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  31.02 
 
 		 561 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  32.07 
 
 		 574 aa  264  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  33.08 
 
 		 566 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  30.86 
 
 		 571 aa  263  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  31.26 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  32.18 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  30.61 
 
 		 592 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  32.57 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  30.81 
 
 		 591 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  30.82 
 
 		 604 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  30.25 
 
 		 578 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  31.91 
 
 		 588 aa  260  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  31.93 
 
 		 571 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  31.6 
 
 		 558 aa  259  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  31.07 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  32.57 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 558 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  31.64 
 
 		 582 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  32.56 
 
 		 569 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  31.53 
 
 		 570 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  31.98 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  31.99 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  32.77 
 
 		 608 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  31.4 
 
 		 591 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 565 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  29.98 
 
 		 609 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  31.66 
 
 		 575 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0349  30S ribosomal protein S1  30.78 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000135822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  29.5 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  30.08 
 
 		 644 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  30 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  30.33 
 
 		 559 aa  243  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  30.22 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  30.04 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  29.33 
 
 		 561 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  29.6 
 
 		 561 aa  237  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  30.18 
 
 		 551 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  30.59 
 
 		 569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  30.18 
 
 		 555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  29.31 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1623  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.04 
 
 		 810 aa  234  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.603124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  29.81 
 
 		 569 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  29.82 
 
 		 566 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  29.68 
 
 		 563 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  30.02 
 
 		 595 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  29.39 
 
 		 563 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  27.21 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  29.07 
 
 		 571 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  29.07 
 
 		 577 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  28.35 
 
 		 568 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  28.35 
 
 		 568 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  28.52 
 
 		 619 aa  230  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2762  30S ribosomal protein S1  30.66 
 
 		 591 aa  230  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.841821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  28.13 
 
 		 558 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  28.88 
 
 		 589 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  28.94 
 
 		 571 aa  229  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  28.62 
 
 		 553 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  28.79 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  28.95 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  28.95 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  28.68 
 
 		 570 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  30.98 
 
 		 569 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  28.88 
 
 		 576 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  28.73 
 
 		 562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  28.88 
 
 		 570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>