More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1709 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  52.04 
 
 		 1007 aa  938    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1008 aa  2006    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  50.05 
 
 		 1008 aa  897    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  49.95 
 
 		 1008 aa  896    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  57.04 
 
 		 1003 aa  1002    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  55.65 
 
 		 1016 aa  1050    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  75.65 
 
 		 1007 aa  1447    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  33.37 
 
 		 1023 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  32.71 
 
 		 1022 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  32.44 
 
 		 1019 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  31.95 
 
 		 1022 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  31.74 
 
 		 1031 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  27.08 
 
 		 859 aa  212  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 859 aa  209  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  26.98 
 
 		 859 aa  208  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  32.37 
 
 		 1000 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  32.18 
 
 		 857 aa  170  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  21.84 
 
 		 961 aa  166  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  21.44 
 
 		 1061 aa  110  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.32 
 
 		 895 aa  108  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  21.81 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  38.73 
 
 		 902 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  21.96 
 
 		 1029 aa  105  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  19.53 
 
 		 993 aa  97.8  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  35.23 
 
 		 891 aa  95.5  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  21.52 
 
 		 1029 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  20.99 
 
 		 864 aa  89.4  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.44 
 
 		 994 aa  89  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  27.85 
 
 		 824 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  29.53 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.89 
 
 		 890 aa  81.3  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  33.16 
 
 		 851 aa  78.2  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.23 
 
 		 978 aa  77.4  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.8 
 
 		 906 aa  76.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  19.64 
 
 		 993 aa  76.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  28.19 
 
 		 1099 aa  75.5  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  28.21 
 
 		 1074 aa  75.1  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.47 
 
 		 1019 aa  75.1  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  31.6 
 
 		 1103 aa  74.7  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  26.18 
 
 		 881 aa  74.7  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  20.22 
 
 		 993 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  28.33 
 
 		 702 aa  73.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  26.82 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  21.4 
 
 		 1009 aa  72.4  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  31.09 
 
 		 1114 aa  72.4  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  23.62 
 
 		 1029 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  21.4 
 
 		 1009 aa  72.4  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.6 
 
 		 1116 aa  72  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  29.82 
 
 		 852 aa  72  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  29.82 
 
 		 852 aa  72  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  24.83 
 
 		 1029 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  26.52 
 
 		 693 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.55 
 
 		 1021 aa  69.7  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  28.5 
 
 		 904 aa  69.3  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  22.67 
 
 		 1180 aa  68.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.18 
 
 		 789 aa  68.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3731  putative DNA repair ATPase  25.78 
 
 		 808 aa  68.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.835682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.34 
 
 		 926 aa  68.6  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  30.08 
 
 		 858 aa  68.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  20.85 
 
 		 638 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  24.15 
 
 		 1029 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  29.67 
 
 		 950 aa  67.8  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  25.72 
 
 		 1018 aa  67.4  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.11 
 
 		 1177 aa  67.4  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  28.49 
 
 		 922 aa  67.4  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.95 
 
 		 1013 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  26.45 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.41 
 
 		 995 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  28 
 
 		 700 aa  67  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  30.05 
 
 		 1172 aa  65.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  27.27 
 
 		 1024 aa  65.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.03 
 
 		 1029 aa  65.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  26.92 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  26.56 
 
 		 1039 aa  65.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  26.81 
 
 		 1155 aa  65.1  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  30.56 
 
 		 1172 aa  65.1  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  25.97 
 
 		 1227 aa  64.7  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  30.46 
 
 		 1165 aa  64.7  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 		 1346 aa  64.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  26.74 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  25.94 
 
 		 1011 aa  62.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  26.79 
 
 		 1018 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  26.24 
 
 		 810 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  26.36 
 
 		 1018 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  26.77 
 
 		 1227 aa  62.4  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30.09 
 
 		 1018 aa  62.4  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  27.03 
 
 		 1227 aa  62  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  25.57 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  25.42 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  24.89 
 
 		 1291 aa  61.6  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 		 1018 aa  61.2  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  26.54 
 
 		 1220 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.89 
 
 		 1030 aa  60.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  26.54 
 
 		 1229 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  26.54 
 
 		 1229 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  29.7 
 
 		 1018 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  27.96 
 
 		 1047 aa  60.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  29.7 
 
 		 1018 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  33.02 
 
 		 1022 aa  60.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.93 
 
 		 1187 aa  60.1  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>