31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3731 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3731  putative DNA repair ATPase  100 
 
 		 808 aa  1618    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.835682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4320  putative DNA repair ATPase  40.34 
 
 		 810 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480369  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5278  hypothetical protein  38.85 
 
 		 774 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366308  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1637  putative DNA repair ATPase  38.85 
 
 		 774 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6218  putative DNA repair ATPase  36.86 
 
 		 757 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.657002 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6786  putative ATPase involved in DNA repair  36.11 
 
 		 773 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2237  putative DNA repair ATPase  33.91 
 
 		 820 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2558  putative DNA repair ATPase  34.84 
 
 		 818 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1571  putative DNA repair ATPase  34.91 
 
 		 822 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.490564  normal  0.107556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  25.57 
 
 		 1008 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  25.1 
 
 		 1022 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.36 
 
 		 859 aa  62.8  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  27 
 
 		 1023 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  26.64 
 
 		 859 aa  61.2  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  27.85 
 
 		 1022 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  25 
 
 		 910 aa  55.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  27.78 
 
 		 859 aa  55.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  27.22 
 
 		 1031 aa  55.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  25.29 
 
 		 1007 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  23.53 
 
 		 1003 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  32.98 
 
 		 1047 aa  52  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.85 
 
 		 1019 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  27.51 
 
 		 857 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  31.06 
 
 		 1022 aa  49.3  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  30.89 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  30.89 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  34.12 
 
 		 1167 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  29.1 
 
 		 1018 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  20.5 
 
 		 1172 aa  45.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  29.84 
 
 		 1007 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  20.42 
 
 		 1172 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>