25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4320 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4320  putative DNA repair ATPase  100 
 
 		 810 aa  1667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480369  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3731  putative DNA repair ATPase  40.34 
 
 		 808 aa  575  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.835682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2237  putative DNA repair ATPase  34.8 
 
 		 820 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2558  putative DNA repair ATPase  33.89 
 
 		 818 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5278  hypothetical protein  33.57 
 
 		 774 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366308  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1637  putative DNA repair ATPase  33.57 
 
 		 774 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6218  putative DNA repair ATPase  33.13 
 
 		 757 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.657002 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6786  putative ATPase involved in DNA repair  32.14 
 
 		 773 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1571  putative DNA repair ATPase  32.32 
 
 		 822 aa  346  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.490564  normal  0.107556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.67 
 
 		 1019 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  27.05 
 
 		 859 aa  62  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  28.72 
 
 		 859 aa  60.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  31.41 
 
 		 857 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  32 
 
 		 1008 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  27.14 
 
 		 1023 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  32.28 
 
 		 859 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  30.89 
 
 		 1016 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.08 
 
 		 1003 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  29.37 
 
 		 1008 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  29.37 
 
 		 1008 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  30.65 
 
 		 1007 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  28.86 
 
 		 1031 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  30.4 
 
 		 1007 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 1022 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 		 1022 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>