30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6786 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5278  hypothetical protein  51.16 
 
 		 774 aa  760    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366308  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6218  putative DNA repair ATPase  52.57 
 
 		 757 aa  764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.657002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1637  putative DNA repair ATPase  51.16 
 
 		 774 aa  760    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6786  putative ATPase involved in DNA repair  100 
 
 		 773 aa  1560    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2237  putative DNA repair ATPase  38.08 
 
 		 820 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2558  putative DNA repair ATPase  38 
 
 		 818 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1571  putative DNA repair ATPase  37.71 
 
 		 822 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.490564  normal  0.107556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3731  putative DNA repair ATPase  36.11 
 
 		 808 aa  422  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.835682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4320  putative DNA repair ATPase  32.26 
 
 		 810 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480369  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  27.67 
 
 		 910 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.91 
 
 		 859 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  27.63 
 
 		 1023 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  21.3 
 
 		 859 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  23.95 
 
 		 1008 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  29.13 
 
 		 1007 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.36 
 
 		 1031 aa  50.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  26.81 
 
 		 1008 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.29 
 
 		 859 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  26.07 
 
 		 1008 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.5 
 
 		 891 aa  49.3  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  24.24 
 
 		 1016 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  31.53 
 
 		 1172 aa  47.8  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  26.35 
 
 		 1165 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  26.34 
 
 		 1007 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  23.62 
 
 		 1003 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  30.63 
 
 		 1172 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1022 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.97 
 
 		 1019 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  26.21 
 
 		 1022 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.02 
 
 		 857 aa  44.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>