More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0970 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 428 aa  869    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  32.3 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  35.42 
 
 		 432 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.24 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  34.24 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.29 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  31.24 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  31.22 
 
 		 428 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  31.74 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  31.44 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  31.29 
 
 		 434 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  31.99 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.44 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 424 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 442 aa  169  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  30.18 
 
 		 428 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.51 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 428 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.21 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 438 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  25.76 
 
 		 430 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 430 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  25.76 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 430 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.65 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.92 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.21 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  31.33 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.56 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  31.37 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.13 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.21 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.61 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  32.1 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.41 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.66 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>