More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3591 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
820 aa  1635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.24 
 
 
807 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  32.2 
 
 
869 aa  356  8.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.14 
 
 
813 aa  340  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.45 
 
 
882 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.93 
 
 
807 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.69 
 
 
823 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.71 
 
 
805 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  30.59 
 
 
796 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.69 
 
 
871 aa  316  9e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.85 
 
 
805 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 
822 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  30.01 
 
 
802 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  29.05 
 
 
814 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.87 
 
 
816 aa  304  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.86 
 
 
817 aa  303  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  30.78 
 
 
798 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  32.25 
 
 
809 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.78 
 
 
831 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  28.42 
 
 
821 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.72 
 
 
862 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  28.5 
 
 
805 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.37 
 
 
800 aa  276  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.86 
 
 
805 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  29.77 
 
 
805 aa  274  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.15 
 
 
805 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.28 
 
 
809 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  28.67 
 
 
811 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  28.55 
 
 
810 aa  270  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  27.52 
 
 
797 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.09 
 
 
887 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  30.08 
 
 
803 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  27.44 
 
 
809 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.63 
 
 
808 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.04 
 
 
893 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.32 
 
 
810 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  29.55 
 
 
808 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.53 
 
 
878 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  29.5 
 
 
804 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.74 
 
 
913 aa  258  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.87 
 
 
874 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 
883 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  27.26 
 
 
845 aa  250  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  29.16 
 
 
887 aa  250  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  29.75 
 
 
808 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.1 
 
 
915 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  29.57 
 
 
808 aa  248  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.25 
 
 
819 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  29.07 
 
 
817 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.1 
 
 
812 aa  244  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.88 
 
 
888 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.83 
 
 
844 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  26.91 
 
 
804 aa  243  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.68 
 
 
835 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.77 
 
 
817 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.58 
 
 
849 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.59 
 
 
879 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.48 
 
 
821 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  29.59 
 
 
816 aa  235  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  28.38 
 
 
865 aa  234  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  27.21 
 
 
803 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  29 
 
 
806 aa  230  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.73 
 
 
855 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  29.48 
 
 
843 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  27.8 
 
 
844 aa  221  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  27.78 
 
 
803 aa  220  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.61 
 
 
919 aa  220  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.18 
 
 
880 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  27.01 
 
 
810 aa  208  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  29.38 
 
 
819 aa  205  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.1 
 
 
828 aa  204  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  27.19 
 
 
808 aa  203  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  28.9 
 
 
848 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.21 
 
 
846 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.35 
 
 
884 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  26.23 
 
 
861 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
809 aa  184  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.61 
 
 
807 aa  182  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  26.08 
 
 
810 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.48 
 
 
931 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 
810 aa  159  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  22.26 
 
 
813 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  27 
 
 
807 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  22.67 
 
 
798 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
817 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 
809 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
805 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 
810 aa  115  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
800 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 
802 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
804 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 
798 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 
792 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  20.75 
 
 
795 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  22.82 
 
 
790 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 
800 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 
811 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  22.14 
 
 
794 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 
809 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 
802 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>