More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0712 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 504 aa  1045    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  68.01 
 
 		 503 aa  679    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  87.07 
 
 		 495 aa  905    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  59.45 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  60.3 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  57.59 
 
 		 478 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  58.04 
 
 		 490 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.44 
 
 		 481 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  59.07 
 
 		 505 aa  581  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 490 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  55.88 
 
 		 488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  56.03 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  54.74 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  55.49 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  55.88 
 
 		 486 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  52.74 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  25.35 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  25.36 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  26.88 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  23.61 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  23.09 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  24.58 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  24.87 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  24.47 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  23.67 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  23.48 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  24.72 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  23.74 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  23.74 
 
 		 477 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  26.44 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  22.6 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  24.51 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  22.73 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.27 
 
 		 369 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  23.46 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0281  hypothetical protein  23.54 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.985205  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  47.62 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  23.09 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  23.8 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  23.71 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  41.1 
 
 		 215 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 196 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 281 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 110 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 211 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 509 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  31.16 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  25.98 
 
 		 483 aa  53.9  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 206 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 203 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 206 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 194 aa  53.5  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 209 aa  53.5  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  23.96 
 
 		 461 aa  53.5  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  27.54 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 192 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  47.69 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  22.89 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  22.36 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  22.89 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>