More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05155 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05155  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  358  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001277  calcium binding protein  83.94 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003092  hypothetical protein  40.11 
 
 		 236 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0245591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02754  hypothetical protein  37.37 
 
 		 236 aa  98.6  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.72 
 
 		 2678 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.76 
 
 		 2885 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  40.22 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.96 
 
 		 556 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.74 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  38.74 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  46.4 
 
 		 1022 aa  87.8  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.97 
 
 		 588 aa  87.8  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  46.4 
 
 		 1017 aa  87.8  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.58 
 
 		 421 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.43 
 
 		 1236 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  37.85 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.75 
 
 		 2667 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.63 
 
 		 1016 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  46.92 
 
 		 260 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  52.58 
 
 		 946 aa  84.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.15 
 
 		 3619 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.15 
 
 		 3619 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.5 
 
 		 1963 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.89 
 
 		 813 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 652 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.02 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.64 
 
 		 2775 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.54 
 
 		 1795 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  44.44 
 
 		 2105 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.33 
 
 		 2346 aa  81.3  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  37.42 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  41.07 
 
 		 1197 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.74 
 
 		 1712 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  42.75 
 
 		 1079 aa  78.6  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  37.42 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  46.96 
 
 		 1895 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  44.44 
 
 		 867 aa  77.8  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.2 
 
 		 2145 aa  77.8  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.23 
 
 		 826 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  39.58 
 
 		 1383 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  36.11 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.23 
 
 		 1279 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.96 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.37 
 
 		 980 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  37.35 
 
 		 795 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  40.98 
 
 		 709 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  46.67 
 
 		 4798 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  52.13 
 
 		 959 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.54 
 
 		 1164 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.95 
 
 		 387 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  46.94 
 
 		 1175 aa  74.7  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.06 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  49.48 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40.46 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  48.86 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  52.13 
 
 		 860 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.69 
 
 		 1372 aa  72.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.45 
 
 		 3427 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  38.73 
 
 		 850 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  52.08 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.95 
 
 		 3608 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  41.32 
 
 		 475 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  31.4 
 
 		 355 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  38.33 
 
 		 2251 aa  72  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  37.95 
 
 		 1156 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  36.71 
 
 		 686 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  44.79 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  39.72 
 
 		 2107 aa  71.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  48.94 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 		 467 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  47.96 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  34.42 
 
 		 2689 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  48.42 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  45.36 
 
 		 1538 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  39.62 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  36.75 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  41.32 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  44.55 
 
 		 742 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.42 
 
 		 4220 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.05 
 
 		 868 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  35.05 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  47.31 
 
 		 744 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.32 
 
 		 1363 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.56 
 
 		 4854 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  39.19 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  33.33 
 
 		 938 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  49.48 
 
 		 485 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  44.12 
 
 		 982 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  35.15 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.73 
 
 		 582 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  49.41 
 
 		 2452 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 4334 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  36.31 
 
 		 1544 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.56 
 
 		 5839 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  50.56 
 
 		 4687 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>