137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3679 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3679  DoxX  100 
 
 
162 aa  329  9e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  46.1 
 
 
181 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  40.94 
 
 
172 aa  94  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  42.06 
 
 
183 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  41.27 
 
 
182 aa  90.9  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  44.92 
 
 
188 aa  90.5  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  42.06 
 
 
183 aa  90.5  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  40.16 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  42.28 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  43.33 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  37.06 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  35.17 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  34.48 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  33.79 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  32.92 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  33.79 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  36.69 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  31.21 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  39.32 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  35.86 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.83 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  33.61 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  32.58 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  37.5 
 
 
198 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  32.5 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  31.78 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.12 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  29.01 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  32.5 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  30.16 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  30.22 
 
 
153 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  28.28 
 
 
137 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  30.53 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  35.66 
 
 
133 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  32.17 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  30 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.61 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  33.04 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  29.92 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  29.51 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  30.6 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  38 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  28.68 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  30.23 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  30.57 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.87 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  29.03 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  29.41 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  31.34 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3120  hypothetical protein  34.71 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  28.8 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  28.35 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  30.23 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  28.8 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  28.8 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  33.05 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3850  DoxX family protein  34.71 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  31.09 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.37 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  29.13 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  28.35 
 
 
197 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  28.35 
 
 
197 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  32.5 
 
 
197 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  27.48 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  30.95 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.78 
 
 
148 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  31.67 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  31.78 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  34.09 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3783  DoxX family protein  31.93 
 
 
152 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  34.09 
 
 
198 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3834  DoxX family protein  31.93 
 
 
152 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  31.82 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  32.03 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  37.8 
 
 
216 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  31.9 
 
 
131 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  28.49 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.82 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  32.91 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  33.04 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30.47 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  28.08 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  28.67 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  29.08 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  31.54 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  27.34 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  32.2 
 
 
131 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  26.45 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.91 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  32.64 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  29.17 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  29.27 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  35.44 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  29.92 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  31.82 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  32.56 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  27.82 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>