28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1631 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  98.31 
 
 
177 aa  355  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  78.18 
 
 
190 aa  274  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  74.43 
 
 
186 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  70 
 
 
186 aa  262  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  72.16 
 
 
186 aa  261  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  73.3 
 
 
186 aa  261  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  63.93 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  37.01 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  32.92 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.37 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  57.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  31.25 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3120  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3850  DoxX family protein  32 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  31.82 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  24.09 
 
 
130 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  26.52 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  28.87 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  28.87 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  25.76 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  28.79 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1811  DoxX family protein  33.06 
 
 
366 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.217697  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  32.56 
 
 
145 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  29.85 
 
 
140 aa  41.6  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  34.44 
 
 
123 aa  40.8  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  26.15 
 
 
130 aa  40.8  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>