76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0957 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  100 
 
 
172 aa  336  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  76.3 
 
 
172 aa  254  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  56.97 
 
 
185 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  63.12 
 
 
185 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  61.82 
 
 
183 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  63.23 
 
 
183 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  61.88 
 
 
182 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  62.42 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  45.45 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  40.16 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  33.06 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  29.19 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  39.84 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  28.17 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  27.66 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  35.61 
 
 
405 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  27.46 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  34.92 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  33.86 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  33.33 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  35.59 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0983  DoxX family protein  30.5 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382706  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  35.87 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  27.48 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  31.71 
 
 
127 aa  48.5  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  33.09 
 
 
133 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  35.96 
 
 
197 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.54 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.76 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  28.8 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  37.78 
 
 
198 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  29.5 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.68 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  32.28 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  37.4 
 
 
211 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  34.4 
 
 
130 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  35.63 
 
 
296 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  33.05 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  32.06 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.08 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  32.85 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  35.8 
 
 
202 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  38.81 
 
 
197 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  34.59 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  36.36 
 
 
137 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  34.85 
 
 
131 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  34.85 
 
 
131 aa  44.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  34.85 
 
 
131 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  38.37 
 
 
297 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  29.37 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  33.1 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  27.55 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  32.03 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  33.06 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  32.06 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  32.06 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  32.06 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  30.16 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  35.8 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  33.06 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  32.06 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  32.82 
 
 
130 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  27.66 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  33.33 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  30.83 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  32.87 
 
 
378 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.14 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  37.31 
 
 
197 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  29.69 
 
 
130 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  32.28 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  31.17 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  34.92 
 
 
130 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  31.69 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>