126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1056 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  100 
 
 
133 aa  262  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  48.25 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  43.75 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  47.41 
 
 
134 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  49.14 
 
 
134 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  46.49 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  46.49 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  49.14 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  45.61 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  45.61 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  45.61 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  45.61 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  45.61 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  45.61 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0916  hypothetical protein  47.52 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000281771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.22 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  39.84 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.81 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  46.88 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  38.35 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  39.23 
 
 
148 aa  59.3  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  35.04 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  37.01 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  39.55 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  34.53 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.78 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  33.59 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.88 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.07 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.64 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.35 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  43.85 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  36.92 
 
 
239 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  33.06 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.92 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  31.71 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  30.83 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  25.55 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  31.25 
 
 
150 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  38.27 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  37.5 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  34.12 
 
 
144 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  28.78 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  38.28 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  28.03 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  37.5 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  33.58 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  37.88 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  40.8 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.28 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  35.43 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  36.67 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.92 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  34.71 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  39.2 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  32.58 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  35.71 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  35.43 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  31.16 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  31.75 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.5 
 
 
133 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  39.36 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  30.43 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  29.63 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  29.63 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  31.16 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.06 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  32.56 
 
 
174 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  31.16 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  34.44 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  37.97 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  36.62 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  31.71 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  36.67 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.62 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  36.54 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  37.8 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  40.24 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  31.71 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  32 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  40.24 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  30.3 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  40.16 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  32 
 
 
133 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  36.9 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  36.64 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  40.48 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  36.64 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  29.36 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  36.64 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  28 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>