179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1115 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  256  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  256  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  256  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  83.97 
 
 		 131 aa  225  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  77.86 
 
 		 130 aa  204  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  74.81 
 
 		 161 aa  202  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  75.57 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  74.81 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  74.81 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  75.57 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  74.81 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  75.57 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  75.57 
 
 		 130 aa  201  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  75.57 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  75.57 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  75.57 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  75.57 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  75.57 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  74.05 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  77.86 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  77.86 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  70.99 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3393  DoxX family protein  69.47 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  54.03 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  53.6 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  47.33 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  58.26 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  52.38 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  45.6 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  50.43 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  47.41 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  48.6 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  48.6 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  48.6 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  45.3 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  42.55 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  44.12 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  45.19 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  40.16 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  43.22 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  45.9 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  40.31 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  40.16 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  37.4 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  39.84 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  41.94 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  34.85 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  37.88 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  36.36 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40.94 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  37.01 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  39.39 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  37.01 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  36.36 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  40.8 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  38.46 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  36.15 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  40.8 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  40.65 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  40.32 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  40.8 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  40.8 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  40.8 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  35.66 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  40.8 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  40.8 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2645  DoxX  39.2 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  37.88 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  40.8 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  37.88 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  42.37 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  37.01 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3431  DoxX family protein  40.18 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  37.4 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  37.59 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  34.48 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  35.48 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  39.66 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  38.94 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  38.05 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  38.05 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  34.45 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  40.71 
 
 		 178 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  36.59 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  38.66 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  35.16 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  35.38 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  36.84 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  36.94 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  42.54 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  36.09 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  39.66 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  39.66 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  38.05 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  39.84 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  38.05 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  38.05 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  35.04 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  34.33 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>