110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1058 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  100 
 
 
172 aa  337  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  76.3 
 
 
172 aa  229  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  60.84 
 
 
183 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  60.71 
 
 
183 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  61.82 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  59.65 
 
 
188 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  57.14 
 
 
185 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  63.95 
 
 
185 aa  190  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  46.77 
 
 
181 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  40.94 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  33.06 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  31.11 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  32.84 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  30.37 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  30.37 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  30.37 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  30.37 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  39.84 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  35.43 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  29.77 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  30.77 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  37.29 
 
 
141 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  35.2 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.94 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  35.96 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0983  DoxX family protein  32.86 
 
 
142 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382706  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  35.29 
 
 
198 aa  51.2  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  33.79 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  29.29 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  33.83 
 
 
405 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  31.75 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32.58 
 
 
131 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  34.62 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  32.35 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  33.06 
 
 
134 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  36.69 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  37.84 
 
 
137 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  32.28 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  34.35 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  28 
 
 
134 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  32.88 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  37.04 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  37.04 
 
 
197 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.33 
 
 
144 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  34.83 
 
 
197 aa  47.4  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  31.2 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  30.53 
 
 
139 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  31.01 
 
 
133 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.58 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  29.27 
 
 
127 aa  45.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  33.86 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  35.96 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  32.82 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  31.62 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  31.2 
 
 
130 aa  44.7  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  35.8 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  33.33 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.33 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  33.33 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  30 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.85 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  31.45 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  30.3 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.01 
 
 
134 aa  44.3  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  33.08 
 
 
131 aa  44.3  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  33.08 
 
 
131 aa  44.3  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  33.08 
 
 
131 aa  44.3  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  29.89 
 
 
204 aa  44.3  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  34.57 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  33.09 
 
 
378 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  32.59 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  27.66 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  29.32 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  29.32 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30.3 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  28 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  30.47 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  30.23 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  30.53 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  28.74 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  34.62 
 
 
133 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  29.32 
 
 
181 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  34.62 
 
 
133 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  30.7 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  32.81 
 
 
130 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  31.45 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  30.51 
 
 
153 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  29.79 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  31.91 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  34.04 
 
 
141 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  34.29 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  28.79 
 
 
296 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  31.06 
 
 
297 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  30.23 
 
 
131 aa  41.2  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  30 
 
 
171 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  35 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  31.47 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>